申请/专利权人:上海市肺科医院(上海市职业病防治院)
申请日:2023-04-20
公开(公告)日:2024-04-05
公开(公告)号:CN117831780A
主分类号:G16H50/70
分类号:G16H50/70;A61K45/06;A61P35/00;G16H50/50;G16H70/40
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开
摘要:本发明提供了一种预测晚期非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂与化疗联合治疗效果的评估指标及其应用,属于生物医药技术领域。本发明通过检测HLA‑Ⅰ趋异进化指数HLA‑ⅠHED和肿瘤细胞阳性比例分数TPS是否满足阈值来预测免疫检查点抑制剂与化疗联合治疗的疗效。同时提供了上述生物评估指标的应用,包括基于该生物评估指标的预测免疫检查点抑制剂与化疗联合治疗的疗效的系统、设备、计算机可读存储介质和试剂盒。基于该生物评估指标和其应用,可以预测晚期非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂与化疗的联合治疗效果,从而制定个性化的联合治疗方案,提高晚期非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂与化疗联合治疗的应答率,提升患者生存获益。
主权项:1.一种评估指标在预测非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂与化疗联合治疗效果中的应用,所述评估指标包括HLA-I趋异进化指数和肿瘤细胞阳性比例分数;所述HLA-I趋异进化指数是指HLA-A、HLA-B和HLA-C中至少一种蛋白的氨基酸链上的差异指数与机体内对应的所含的HLA-A、HLA-B和HLA-C氨基酸链之间进行两两组合的次数的比值,根据所述比值求平均值得到HLA-I趋异进化指数;所述差异指数是格兰瑟姆距离Granthamdistance,所述格兰瑟姆距离Granthamdistance按照公式I计算获得:Granthamdistance=∑Dij=∑[αci-cj2+βpi-pj2+γvi-vj2]12公式I其中,i和j表示不同待分析氨基酸链上的两个氨基酸;Dij表示i和j两个氨基酸之间的格兰瑟姆距离Granthamdistance;c表示氨基酸的组成,ci表示i氨基酸的组成,cj表示j氨基酸的组成;p表示氨基酸的极性,pi表示i氨基酸的极性,pj表示j氨基酸的极性;v表示氨基酸的分子量,vi表示i氨基酸的分子量,vj表示j氨基酸的分子量;α、β和γ表示任一常数;所述肿瘤细胞阳性比例分数是指任何表达强度的PD-L1蛋白表达的肿瘤细胞在全部肿瘤细胞中的数量占比。
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权利要求:
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