申请/专利权人:东南大学
申请日:2021-04-09
公开(公告)日:2024-04-12
公开(公告)号:CN113096739B
主分类号:G16B40/00
分类号:G16B40/00;G16H50/30
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.04.12#授权;2021.07.27#实质审查的生效;2021.07.09#公开
摘要:本发明公开一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法,标志物组合包括如下基因:CSPG5,CXCL10,CXCL11,DKK1,PI3,TNFRSF17,DUOX1,TNFRSF13B和PAEP;分析方法包括:S1、数据收集和预处理;S2、TMB分数的计算和预后分析;S3、差异分析;S4、TMB‑免疫预后相关风险评分模型的构建和评估;S5、确立临床病理因素和TMB‑IRS模型的关系;S6、CIBERSORT数据库分析;S7、统计分析。本发明通过卵巢癌9个关键的肿瘤突变负荷相关免疫预后基因,构建与TMB有关的免疫风险评分模型,将患者分为高风险组和低风险组,证明了高风险组与较差的预后有关,以及低风险组患者的免疫细胞浸润比例更高;为卵巢癌的临床治疗提供预后提示,可作为预测卵巢癌预后的新型生物标志物和潜在治疗靶标。
主权项:1.一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法,包括如下步骤:S1、数据收集和预处理;S2、TMB分数的计算和预后分析;S3、差异分析;S4、TMB-免疫预后相关风险评分模型的构建和评估;S5、确立临床病理因素和TMB-IRS模型的关系;S6、CIBERSORT数据库分析;S7、统计分析;所述S2由突变数除以外显子长度计算得出每个人的TMB得分,再根据中位数将卵巢癌样本分为高TMB组和低TMB组;运用Kaplan-Meier生存曲线分析比较两组之间的总生存期差异,Kaplan-Meier生存曲线的生存率公式如下: 上式中n为存活总人数,d为事件发生数目,接着对卵巢癌患者的体细胞突变情况进行可视化处理。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 东南大学 一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法
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