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【发明公布】一种多束扫描电镜图像数据的批量高速访问方法_合肥综合性国家科学中心人工智能研究院(安徽省人工智能实验室)_202410180437.1 

申请/专利权人:合肥综合性国家科学中心人工智能研究院(安徽省人工智能实验室)

申请日:2024-02-18

公开(公告)日:2024-04-19

公开(公告)号:CN117908801A

主分类号:G06F3/06

分类号:G06F3/06

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.07#实质审查的生效;2024.04.19#公开

摘要:本发明公开了一种多束扫描电镜图像数据的批量高速访问方法。本发明中,设置每次写入的总大小与LinuxEXT4文件系统一个数据组的大小相等,即128MB。这么做是为了在磁盘上创建单个大文件时,其在磁盘上能够尽可能地占据一片连续的空间。这样在后续将内存中的文件数据冲入这片空间时就能够实现文件数据的批量顺序写入,在不改变文件系统的结构上,改变传统顺序读取单个文件的做法,而采用先读取多个文件的元数据,然后根据元数据信息调整文件读取顺序,目标是实现对多个文件内容的批量顺序读取与写入,大幅提升了脑图谱研究过程中对电镜数据集的访问效率。

主权项:1.一种多束扫描电镜图像数据的批量高速访问方法,其特征在于:所述多束扫描电镜图像数据的批量高速访问方法包括以下步骤:S1:先进行多束扫描电镜图像数据批量读取,批量读取一组电镜图像数据的元数据信息;S2:利用提取到的元数据,确定每个文件连续数据段在磁盘上的确切物理位置,并按物理位置顺序重新组织读取请求;S3:直接向磁盘发送读取指令,一次性顺序地将这组电镜图像数据高效地载入内存;S4:之后进行多束扫描电镜图像数据批量写入,当读流程将一组电镜图像数据全部读入内存后,在磁盘上创建一个能够容纳这组文件的单个大文件;S5:直接向磁盘发出指令,将内存中这组电镜图像数据的文件数据一次性冲入该大文件所在的磁盘空间;S6:根据每个文件数据段在磁盘上新的位置,批量更新这组电镜图像数据元数据信息;S7:使用多束扫描电镜图像数据缓存模型对多束扫描电镜图像数据进行缓存;S8:申请一大块内存空间,作为整个系统的内存池;根据待访问的文件大小、文件系统每个数据块的大小,将上述步骤中的内存池划分为多组小额区块,并用多个自由链表去维护这些区块;S9:当读流程读取某段文件数据,申请一片内存空间时,从上述步骤中找到合适的自由链表,从中取出一个空闲区块返回给读流程;S10:当写流程完成某段文件数据的写入,需要释放内存空间时,将对应的区块插回到所属的自由链表中。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 合肥综合性国家科学中心人工智能研究院(安徽省人工智能实验室) 一种多束扫描电镜图像数据的批量高速访问方法

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