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【发明公布】基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统_中国科学院动物研究所_202310830408.0 

申请/专利权人:中国科学院动物研究所

申请日:2023-07-07

公开(公告)日:2024-04-26

公开(公告)号:CN117925777A

主分类号:C12Q1/6806

分类号:C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06;G16B30/10

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开

摘要:本发明公开基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统。本发明的测序方法包括在去除核糖体RNA的总RNA样本中,利用多路反转录法取得全转录组的全长cDNA;将全转录组的全长cDNA片段进行环化和滚环扩增,并根据片段大小筛选得到目标产物,利用目标产物构建纳米孔测序文库;在上机测序时,选择性富集靶标转录本;并利用特定算法同时获得靶标与非靶标分子的丰度信息,进而评估转录本的真实丰度信息。本发明的方法和系统可以在富集目的转录本的同时,对全基因组进行无偏定量。此外,本发明还在测序过程中提供可编程的控制系统,可以让用户批量指定富集靶标。本发明的方法在临床快速诊断和靶向转录本富集的场景具有广泛的应用前景。

主权项:1.一种基于三代测序技术的靶向RNA测序方法,其特征在于,包括以下步骤:1在去除核糖体RNA的总RNA样本中,利用多路反转录法取得全转录组的全长cDNA;2将所述全转录组的全长cDNA片段进行环化和滚环扩增,并根据片段大小筛选得到目标产物,利用目标产物构建纳米孔测序文库;3在上机测序时,选择性富集靶标转录本;和4同时获得靶标与非靶标分子的丰度信息,进而评估转录本的真实丰度信息。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院动物研究所 基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统

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