申请/专利权人：中国农业科学院蔬菜花卉研究所

申请日：2024-01-30

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN117935904A

主分类号：G16B15/00

分类号：G16B15/00;G16B30/00;G16B50/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.05.14#实质审查的生效;2024.04.26#公开

摘要：本发明公开了一种基于Python语言快速设计DNA四面体的方法，涉及生物材料技术领域。本发明提供了一种简便、易于操作的、基于Python语言的多功能DNA四面体设计方法。采用本发明提供的设计方法能在较短的时间内完成DNA四面体四条寡核苷酸链的序列设计，所需的计算机硬件配置简单。基于Python语言的可编辑性，科研人员还可以对四条寡核苷酸链添加特定的序列，从而实现多功能DNA四面体的设计，极大地提高设计效率。

主权项：1.一种基于Python语言快速设计DNA四面体的方法，其特征在于，其包括如下步骤：S1：基于DNA四面体的设计原则，使用Python语言编写硬件执行文件；其中，在编写Python代码时，先输入随机碱基；然后基于A、T、C和G碱基生成目标长度的寡核苷酸链；再核对目标长度寡核苷酸链中的GC含量，保留寡核苷酸链中的GC含量大于50％的寡核苷酸链；再核对GC含量大于50％的寡核苷酸链中的二级结构，若不含二级结构，则保留该寡核苷酸链；再设置棱长度，生成有效的寡核苷酸链；分别生成DNA四面体的12条棱组成的4条寡核苷酸链，12条棱包括：棱1、棱2、棱3、棱4、棱5、棱6、棱1’、棱2’、棱3’、棱4’、棱5’和棱6’；所述4条寡核苷酸链分别为第一寡核苷酸链、第二寡核苷酸链、第三寡核苷酸链和第四寡核苷酸链；且第一寡核苷酸链包括棱1、棱2和棱3，第二寡核苷酸链包括棱1’、棱6和棱5，第三寡核苷酸链包括棱4’、棱2’和棱5’，第四寡核苷酸链包括棱4、棱6’和棱3’；其中，棱1和棱1’反向互补，棱2和棱2’反向互补，棱3和棱3’反向互补，棱4和棱4’反向互补，棱5和棱5’反向互补，棱6和棱6’反向互补，定义每条寡核苷酸链的转角处的碱基数为0-3bp；所述寡核苷酸链的转角即为所述DNA四面体的顶点；S2：运行所述硬件执行文件；输出DNA四面体的寡核苷酸链。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 一种基于Python语言快速设计DNA四面体的方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD