申请/专利权人：哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

申请日：2023-05-22

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN116884473B

主分类号：G16B15/20

分类号：G16B15/20;G16B40/00;G06F18/214;G06F18/241

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.26#授权;2023.10.31#实质审查的生效;2023.10.13#公开

摘要：本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置，包括获取训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标，并根据其进行图论方法生成蛋白质二维接触图；对训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标进行算法处理获取第一特征矩阵，对蛋白质二维接触图进行算法处理获取第二特征矩阵，第一特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中序列作用位点对应，第二特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中结构作用折叠结构对应；根据第一特征矩阵和第二特征矩阵分别对应的数据标签训练预先构建的蛋白质功能分类器，得到蛋白质功能预测模型。通过将训练蛋白质的氨基酸结构和序列作为信息源提取特征，提高了预测模型对蛋白质功能的预测精度。

主权项：1.一种蛋白质功能预测模型生成方法，其特征在于，所述方法包括：获取训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标，基于蛋白质的氨基酸三维原子坐标图论方法生成蛋白质二维接触图；具体包括：基于三维原子坐标计算任意两氨基酸残基相对距离，若所述相对距离小于1纳米则两氨基酸残基通过连边相连，并生成以蛋白质的氨基酸三维原子坐标展开为二维矩阵以邻接矩阵的方式存储蛋白质的蛋白质二维接触图；对所述训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标进行算法处理获取第一特征矩阵，所述第一特征矩阵与所述训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中序列作用位点对应；对所述蛋白质二维接触图进行算法处理获取第二特征矩阵，所述第二特征矩阵与所述训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中结构作用折叠结构对应；根据所述第一特征矩阵和所述第二特征矩阵对应的数据标签，并结合所述第一特征矩阵和所述第二特征矩阵对应的数据标签训练预先构建的蛋白质功能分类器，得到蛋白质功能预测模型。

全文数据：

权利要求：

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