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【发明公布】单细胞转录组R数据中gene symbol的校正方法及系统_深圳华大基因科技服务有限公司_202211575459.5 

申请/专利权人:深圳华大基因科技服务有限公司

申请日:2022-12-08

公开(公告)日:2023-04-07

公开(公告)号:CN115938476A

主分类号:G16B20/00

分类号:G16B20/00;G16B40/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.04.25#实质审查的生效;2023.04.07#公开

摘要:本发明公开了一种单细胞转录组R数据中genesymbol的校正方法及系统,其方法包括以下步骤:获取参考基因组原始基因表,根据预设genesymbol替换条件,将所述参考基因组原始基因表中的genesymbol进行转换,生成目标对照表;获取Seurat分析包中的单细胞转录组R对象数据,根据所述R对象数据的数据存储类型调用对应的函数;在每一种函数中,根据目标对照表中的genesymbol校正R对象数据中的genesymbol;通过调用不同类型的函数来针对性的对R对象数据进行校正,可有效提高单细胞转录组R对象数据中genesymbol的准确性,提高流程的连贯性以及避免代码冗余。

主权项:1.一种单细胞转录组R数据中genesymbol的校正方法,其特征在于,包括以下步骤:获取参考基因组原始基因表,根据预设genesymbol替换条件,将所述参考基因组原始基因表中的genesymbol进行转换,生成目标对照表;获取Seurat分析包中的单细胞转录组R对象数据,根据所述R对象数据的数据存储类型调用对应的函数;在每一种函数中,根据目标对照表中的genesymbol校正R对象数据中的genesymbol。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 深圳华大基因科技服务有限公司 单细胞转录组R数据中gene symbol的校正方法及系统

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