申请/专利权人:山东大学
申请日:2022-11-23
公开(公告)日:2023-04-18
公开(公告)号:CN115976178A
主分类号:C12Q1/6869
分类号:C12Q1/6869;G16B20/30;G16B20/50;G16B50/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2023.05.05#实质审查的生效;2023.04.18#公开
摘要:本发明涉及基于纳米孔宏基因组测序的SFTSV检测方法。本发明提出了一种融合序列非依赖的单引物扩增和纳米孔宏基因组测序的SFTSV检测方法,研发了一套自动化、实时的生物信息数据分析流程,可应用于宏基因组测序数据的物种鉴定、SFTSV全基因组组装、SFTSV基因型和重排特征解析等方面。
主权项:1.一种基于纳米孔宏基因组测序的SFTSV检测方法,其特征在于,包括如下步骤:1构建血清样本;2使用定量反转录-聚合酶链反应定量Hazara病毒液的病毒载量,向血清样本中加入Hazara病毒作为测序阳性内对照;3对血清样品提取RNA,并去除DNA和纯化RNA;使用序列非依赖的单引物扩增SISPA方法扩增cDNA;4对血清样品进行测序,构建多重测序文库;将测序文库装载到纳米孔R9.4.1测序芯片上,使用纳米孔MinlON测序仪进行测序;5进行生物信息数据分析。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 山东大学 基于纳米孔宏基因组测序的SFTSV检测方法
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