申请/专利权人：因美纳有限公司

申请日：2021-09-15

公开（公告）日：2023-05-16

公开（公告）号：CN116134525A

主分类号：G16B30/00

分类号：G16B30/00

优先权：["20200915 US 63/078890"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.06.06#实质审查的生效;2023.05.16#公开

摘要：公开了用于软件加速基因组数据读段映射的方法、系统、装置和计算机程序。在一个方面，该方法可包括以下动作：从基因组数据读段获得k聚体种子；基于所获得的k聚体种子生成基因组签名；使用散列数据结构确定与该k聚体种子的至少一部分匹配的参考序列位置，其中该散列数据结构包括N个数据单元，这些数据单元包括第一部分和第二部分，该第一部分存储预先确定的基因组签名，该第二部分存储与同该预先确定的基因组签名所来源于的k聚体种子的至少一部分匹配的参考序列位置的第一次出现相对应的值；以及基于一个或多个比对分数选择所确定的参考序列位置作为所获得的k聚体种子的实际比对。

主权项：1.一种用于软件加速基因组数据读段映射的方法，所述方法包括：由一个或多个计算机从基因组数据读段获得k聚体种子；由所述一个或多个计算机基于所获得的k聚体种子生成基因组签名；由一个或多个计算机使用散列数据结构确定与所述k聚体种子的至少一部分匹配的参考序列位置，其中所述散列数据结构包括N个数据单元，所述数据单元包括第一部分和第二部分，所述第一部分存储预先确定的基因组签名，所述第二部分存储与同所述预先确定的基因组签名所来源于的k聚体种子的至少一部分匹配的参考序列位置的第一次出现相对应的值；以及由一个或多个计算机基于一个或多个比对分数选择所确定的参考序列位置作为所获得的k聚体种子的实际比对。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 因美纳有限公司 软件加速基因组读段映射

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