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【发明公布】一种甘菊4号同源染色体区分/鉴定用BAC克隆及其应用_南京农业大学_202311105682.8 

申请/专利权人:南京农业大学

申请日:2023-08-30

公开(公告)日:2023-12-01

公开(公告)号:CN117143966A

主分类号:C12Q1/6841

分类号:C12Q1/6841;C12N15/11

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.12.19#实质审查的生效;2023.12.01#公开

摘要:本发明提供了一种甘菊4号同源染色体区分鉴定用BAC克隆及其应用,属于分子细胞遗传学研究技术领域。本发明首先利用甘菊HindⅢ酶切位点BAC文库随机筛选BAC克隆提取质粒,然后利用缺刻平移法将BAC质粒标记成荧光BAC探针制成杂交液,接着预处理甘菊根尖细胞有丝分裂中期染色体样品,将BAC探针和甘菊染色体样品进行杂交,经过显微镜观察和图像分析,最终发现一个特异BAC克隆能够将甘菊1对同源染色体进行区分和鉴定,比对序列发现特异信号定位在甘菊4号同源染色体上。本发明所提供的探针和方法能够高效、准确地区分甘菊4号同源染色体,操作简便,与传统方法相比显著提高了甘菊4号同源染色体的鉴定速度和鉴定准确性。

主权项:1.一种甘菊Chrysanthemumlavandulifolium4号同源染色体区分鉴定用BAC克隆,其特征在于,所述甘菊4号同源染色体区分鉴定用BAC克隆的获得方法包括以下步骤:1从甘菊HindⅢ酶切位点BAC文库中随机挑选BAC克隆,并提取BAC质粒;2利用缺刻平移法将所述BAC质粒标记为荧光BAC探针;使用两种BAC质粒缺刻平移标记体系,绿色信号标记体系和红色信号标记体系;所述绿色信号标记体系包括:10×NEBuffer2.0μL,dNTPs2.5μL,BAC质粒16.0μL,ddH2O2.7μL,DNAPolymeraseIE.coli0.8μL,DNaseI0.5μL,Fluorescein-12-dUTP0.5μL;所述红色信号标记体系包括:BAC质粒16.0μL,DIGNickTranslationMix4.0μL;所述标记方法为:将所述标记体系于0.2mLPCR管中混匀,金属浴避光标记90min,取出后加入1μL0.5MEDTA溶液终止反应,即制得所述荧光BAC探针;3将所述荧光BAC探针制备成BAC探针杂交液;所述杂交液每个制片使用量的成分组成为:dFA7.5μL,20×SSC1.2μL,体积百分比为50.0%的硫酸葡聚糖DextranSulfate3.0μL,所述荧光BAC探针2.0μL,ddH2O1.3μL;所述制备方法为:将所述成分组成于PCR管中混匀,振荡离心后置于PCR仪中95℃变性13min,取出后迅速置于冰上处理6min以上,即制得所述BAC探针杂交液;4使用所述BAC探针杂交液进行甘菊高分辨率染色体荧光原位杂交,产生特异信号且测序后与NCBI中甘菊基因组序列比对并定位后发现其信号位于甘菊4号同源染色体末端的,即为所述甘菊4号同源染色体区分鉴定用BAC克隆。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 南京农业大学 一种甘菊4号同源染色体区分/鉴定用BAC克隆及其应用

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