申请/专利权人:华中农业大学
申请日:2023-10-23
公开(公告)日:2024-01-23
公开(公告)号:CN117431294A
主分类号:C12Q1/6804
分类号:C12Q1/6804;C12Q1/6806;C12Q1/6895;C12Q1/6869;G01N33/53;C40B50/06
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.02.09#实质审查的生效;2024.01.23#公开
摘要:本发明涉及一种针对植物经济器官的ChIP‑seq染色质免疫共沉淀方法,针对现有方法难以在种子、果实和块茎等材料中产出合格DNA‑蛋白质互作数据问题提供aChIP实验新技术。在确保染色质分离效率的基础上,利用离心沉淀和改进缓冲液配方等方式去除材料中复杂的细胞内含物,并对染色质进行浓缩以高效获得干净、高浓度的片段化染色质,最终在植物经济器官中获得高质量ChIP‑seq数据。该方法快速高效、灵敏高质、适用性广,不仅适用于常规植物组织,更适用于富含油脂、淀粉、糖、有机酸和酚等物质的植物经济器官,拓展了植物种子发育、休眠和萌发,果实成熟和营养物质积累等领域的表观遗传学、功能基因组学和基因转录调控的研究。
主权项:1.一种针对植物经济器官的ChIP-seq染色质免疫共沉淀方法,其特征在于,包括如下步骤:1收集材料,进行甲醛交联固定;2依次加入清洗bufferZ1、bufferZ2、bufferZ3和bufferZ4,并分别利用低速离心过滤;3使用超声波片段化染色质;4将片段化的染色质用于后续ChIP-seq实验的进行。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 华中农业大学 一种针对植物重要经济器官的ChIP-seq染色质免疫共沉淀方法
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