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【发明公布】一种Perturb-seq实验的成本分析方法及系统_清华大学_202311548915.1 

申请/专利权人:清华大学

申请日:2023-11-20

公开(公告)日:2024-03-05

公开(公告)号:CN117649882A

主分类号:G16B40/00

分类号:G16B40/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.03.22#实质审查的生效;2024.03.05#公开

摘要:本发明涉及生物信息技术领域,公开一种Perturb‑seq实验的成本分析方法及系统,包括:根据目标gRNA信息和目标基因信息,得到目标gRNA的感染效率、目标gRNA对目标基因的扰动数据、预设显著水平数据、和预设功效数据,估算用于检测目标基因受到目标gRNA的影响的细胞数量;根据估算得到的细胞数量,进行实验成本分析和gRNA比例分析,得到优化实验方案。本发明估算得到的细胞数量既有利于实验人员进行实验,又能够进行实验成本分析,当用户认为实验成本过高时可以对细胞数量进行适量删减,当目标gRNA为多个时,还可以优化gRNA比例分配,以降低实验成本,避免浪费生物资源,提高实验效率。

主权项:1.一种Perturb-seq实验的成本分析方法,其特征在于,包括:得到目标gRNA信息;根据目标gRNA信息,得到目标基因信息;根据目标gRNA信息和目标基因信息,得到目标gRNA的感染效率、目标gRNA对目标基因的扰动数据、预设显著水平数据、和预设功效数据,估算用于检测目标基因受到目标gRNA的影响的细胞数量;根据估算得到的细胞数量,进行实验成本分析和gRNA比例分析,得到Perturb-seq实验的成本数据和gRNA比例数据。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 清华大学 一种Perturb-seq实验的成本分析方法及系统

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