申请/专利权人：上海科技大学

申请日：2023-04-28

公开（公告）日：2024-03-01

公开（公告）号：CN116564408B

主分类号：G16B20/50

分类号：G16B20/50;G16B40/00;G06N5/025;G06F16/36;G06N3/045;G06N3/0442

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.01#授权;2023.08.25#实质审查的生效;2023.08.08#公开

摘要：本申请提供基于知识图谱推理的合成致死基因对预测方法、装置、设备及介质，所述方法包括：获取合成致死知识图谱和已知合成致死基因对；将合成致死知识图谱和由已知合成致死基因对所构成的合成致死图合并生成对应的异构图，以基于异构图及预设起始基因构建得到一用于预测所述预设起始基因的若干个搭档基因的预测模型；基于一多分类损失函数来训练优化预测模型。本发明在无需采样邻居的前提下充分利用KG的结构预测SL关系并对预测过程进行解释，将SL预测问题定义为搭档基因的推荐问题。实验表明，在三种数据划分场景下，KR4SL在NDCG，Precision和Recall上的表现和均优于所有的基线模型。

主权项：1.一种基于知识图谱推理的合成致死基因对预测方法，其特征在于，包括：获取合成致死知识图谱和已知合成致死基因对；将所述合成致死知识图谱和由所述已知合成致死基因对所构成的合成致死图合并生成对应的异构图，以基于所述异构图及预设起始基因构建得到一用于预测所述预设起始基因的若干个搭档基因的预测模型；基于一多分类损失函数来训练优化所述预测模型；其中，基于所述异构图及预设起始基因构建得到一用于预测所述预设起始基因的若干个搭档基因的预测模型，其包括：基于所述合成致死知识图谱为起始基因同为所述预设起始基因的所有基因对构建关系有向图；基于所述关系有向图计算从起始基因传播到知识图谱中各层各节点的语义信息表示；基于从起始基因传播到知识图谱中各层各节点的语义信息表示，计算各层邻居节点中的候选搭档基因，计算各所述候选搭档基因与所述起始基因之间的配对可能性，并挑选其中配对可能性大的若干个候选搭档基因作为所述起始基因的搭档基因。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 上海科技大学 基于知识图谱推理的合成致死基因对预测方法、装置、设备及介质

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