申请/专利权人：浙江农林大学

申请日：2023-12-22

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN117746996A

主分类号：G16B40/20

分类号：G16B40/20;C12Q1/6869;C12Q1/6895

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.09#实质审查的生效;2024.03.22#公开

摘要：简单重复序列SSR是众多物种中广泛分布的基因组序列重复模式。本发明公开了基于特异和多态SSR序列的多种杜鹃花品种鉴定方法，属于植物品种鉴定技术领域。采用了品种内特异性SSR及品种间多态性SSR的数字特征，结合t‑SNE算法和K近邻算法的方案来鉴定多个杜鹃花的品种。摒弃了传统的引物设计和凝胶电泳的步骤，有效减少时间成本及实验成本。并可以不断的补充新的测序数据进行学习和训练，使得识别精度和识别的广度随着数据的增加而提高，提高品种鉴定的泛化性能。

主权项：1.基于特异和多态SSR序列的多种杜鹃花品种鉴定方法，其特征是，包括以下步骤：步骤S01：样品采集和保存；步骤S02：样品DNA提取、文库构建及上机测序，获得测序读段；步骤S03：从头组装测序读段，从组装序列中识别SSR；步骤S04：根据识别结果，判定非复合型SSR；步骤S05：计算非复合型SSR中重复单元的数字特征；步骤S06：提取品种内特异性SSR及品种间多态性SSR数据；步骤S07：使用t-SNE算法得到训练样本的降维特征，并使用K近邻算法进行训练；步骤S08：使用训练的K近邻模型对待预测样本品种进行鉴定；步骤S09：重复步骤S01-S07，增加测序的个体数据和品种类型，提高杜鹃花品种鉴定泛化性。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 浙江农林大学 基于特异和多态SSR序列的多种杜鹃花品种鉴定方法

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