申请/专利权人：深圳蓝晶生物技术有限公司

申请日：2022-09-09

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN116110499B

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B45/00;G16B30/10;G16B50/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.02#授权;2023.05.30#实质审查的生效;2023.05.12#公开

摘要：本发明提供一种用于生物学的分类计算模型及元件库系统，该分类计算模型用于基于生物学系统要素的特征划分并建立合成生物学的基本单元模型，基本单元模型用于整合并关联生物学中的一个或多个系统要素；其中，基本单元模型包括功能元件子模型、复制单元子模型、生物系统子模型、代谢产物子模型和实验方法子模型。通过该分类计算模型可对获得的生物学数据进行准确且有效的整合及分类分析，并构建出系统要素之间普遍的关联映射；同时本发明基于该分类计算模型构建了一种结构化、可溯源且具有检索功能的元件库系统，极大地方便用户对合成生物学数据进行录入和管理，实验及应用数据的收集和归档，数据资源和应用经验的分析和利用。

主权项：1.一种元件库系统，其特征在于，所述元件库系统包括：分类计算模型、数据获取模块、数据预处理模块、数据关联模块、存储模块和数据分析模块；所述分类计算模型，用于基于生物学系统要素的特征划分并建立生物学中的基本单元模型；所述基本单元模型用于整合并关联生物学数据中的一个或多个系统要素；其中，所述基本单元模型包括功能元件子模型、复制单元子模型、生物系统子模型、代谢产物子模型和实验方法子模型；所述功能元件子模型，用于整合所述系统要素中的DNA脱氧核糖核酸，建立对应的不可分割的DNA脱氧核糖核酸片段组件；所述复制单元子模型，用于整合所述系统要素中的以单一整体为单位进行复制的核酸分子或底盘宿主细胞；所述生物系统子模型，用于整合所述系统要素中的记录和描述功能测试实验结果的生物材料；所述代谢产物子模型，用于整合所述系统要素中的代谢产物；所述实验方法子模型，用于整合所述系统要素中的实验操作流程和实验检测方法；所述基本单元模型之间基于生物学特征相互关联映射，所述关联映射包括单向关联映射和或双向关联映射；基于所述关联映射将生物学中的一个或多个系统要素进行关联；其中，所述功能元件子模型的将合成生物学系统要素中的功能元件对应的数据进行解析；所述功能元件包括基础元件和复合元件；所述复合元件为由基础元件或其它复合元件组装的元件；所述复制单元子模型将合成生物学系统要素中的复制单元对应的数据进行解析；所述复制单元与所述功能元件之间为双向关联关系；所述复制单元中包括多个功能元件，且每个功能元件可用于统计出参与构成的所有复制单元；所述生物系统子模型将合成生物学系统要素中的生物系统对应的数据进行解析；所述生物系统与所述功能元件之间为双向关联关系；所述生物系统中包括多个复制单元，且每个复制单元可用于统计出参与构成的所有生物系统；所述代谢产物子模型将合成生物学系统要素中的代谢产物对应的数据进行解析；所述代谢产物与所述生物系统之间为双向关联关系；所述代谢产物为单一或多个生物系统，产生的初级或次级代谢产物或产物集合，且每个生物系统可用于统计出所属代谢产物的生成；所述实验方法子模型将合成生物学系统要素中的实验方法对应的数据进行解析；所述实验方法与所述复制单元、所述实验方法与所述生物系统，以及所述实验方法与所述代谢产物之间为双向关联关系；所述实验方法可以被复制单元、生物系统或代谢产物所涉及的实验所引用；基于所述分类计算模型，在所述数据获取模块获取一个或多个系统要素数据后，通过所述数据预处理模块、数据关联模块和数据分析模块，关联并整合所述获取得到系统要素数据；并通过所述存储模块进行存储；其中，所述数据预处理模块用于对所述数据获取模块获取到系统要素的数据进行处理，将处理后的数据整合到各个基本单元模型；所述数据关联模块用于建立各个所述基本单元模型的关联映射和系统要素之间的关联映射；所述存储模块用于存储各个所述基本单元模型以及所述基本单元模型的关联映射和系统要素之间的关联映射，并将各个所述基本单元模型同步至数据搜索引擎；所述数据分析模块用于响应数据搜索引擎，自动匹配所述基本单元模型以及进行相似度分析。

全文数据：

权利要求：

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