申请/专利权人：康美药业股份有限公司;康美华大基因技术有限公司

申请日：2021-09-07

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN113897423B

主分类号：C12Q1/6869

分类号：C12Q1/6869;C12Q1/02;C12Q1/6883;G16B40/00;G06F18/243;G06N20/20;C12R1/15;C12R1/145;C12R1/46;C12R1/225;C12R1/22;C12R1/21;C12R1/04;C12R1/245;C12R1/01

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.02#授权;2022.01.25#实质审查的生效;2022.01.07#公开

摘要：本发明公开一种类风湿关节炎肠道微生物的标志物组及早期诊断试剂盒，类风湿关节炎肠道微生物的标志物组包括43种差异微生物组合，该类风湿关节炎肠道微生物组合可用于类风湿关节炎风险预估。该类风湿关节炎的早期诊断试剂盒是包括针对上述生物标记物组的探针和或引物，经验证该试剂盒具有较高的检出率和较高的准确度，可以综合地体现类风湿关节炎患者的肠道微生物差异状况，可用于类风湿关节炎的早期发现，为患者争取时间，尽早开始治疗，提高临床治疗效果。

主权项：1.一种类风湿关节炎肠道微生物的标志物组，其特征在于，包括以下肠道微生物：帕梅拉戈登氏杆菌Gordonibacterpamelaeae,Citrobacterunclassified,Dialistersuccinatiphilus,多氏菌Doreaformicigenerans,两形真杆菌Eubacteriumbiforme,巨单胞菌未分类Megamonasunclassified,硬棒状杆菌Corynebacteriumdurum,产气荚膜梭菌Clostridiumperfringens,马其顿链球菌Streptococcusmacedonicus,不明显另枝菌Alistipesindistinctus,唾液乳杆菌Lactobacillussalivarius,极巨巨单胞菌Megamonashypermegale,光冈链型杆菌Catenibacteriummitsuokai,龋齿罗菌Rothiadentocariosa,毛螺菌科细菌1_4_56FAALachnospiraceaebacterium1_4_56FAA,未分类伊格尔兹氏菌Eggerthellaunclassified,痢疾志贺氏菌Sutterellawadsworthensis,未分类梭状杆菌Oscillibacterunclassified,微好气戴阿利斯特菌Dialistermicraerophilus,灵巧粪球菌Coprococcuscatus,弗氏柠檬酸杆菌Citrobacterfreundii,肺炎克雷伯菌Klebsiellapneumoniae,ClostridialesbacteriumBV3C26,嗜木聚糖副普雷沃菌Paraprevotellaxylaniphila,Lachnospiraceaebacterium7_1_58FAA,巨单胞菌Megamonasrupellensis,旧金山乳杆菌Lactobacillussanfranciscensis,克拉副普雷沃菌Paraprevotellaclara,副干酪乳杆菌Lactobacilluscaseiparacasei,产气柯林斯菌Collinsellaaerofaciens,粪便拟杆菌Bacteroidesstercoris,乳酸瘤胃球菌Ruminococcuslactaris,胸膜类杆菌Bacteroidesplebeius,人排泄物副萨特氏菌Parasutterellaexcrementihominis,伯克霍尔德菌细菌1_1_47Burkholderialesbacterium1_1_47,人体普氏菌Prevotellacopri,两歧双歧杆菌Bifidobacteriumbifidum,丝状霍尔德曼氏菌Holdemaniafiliformis,副杆菌Parabacteroidesdistasonis,副流感嗜血菌Haemophilusparainfluenzae,瘤胃乳杆菌Lactobacillusruminis,黏性放线菌Actinomycesviscosus和克雷伯氏菌34KlebsiellaphageKP34；采用随机森林分类器对所述标志物组中的肠道微生物进行分类器模型拟合，通过对模型参数调整，获得最佳分类模型，选取出对模型重要性最高的前30个微生物作为重要差异微生物，使用随机森林分类器模型预测检测者类风湿关节炎概率。

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