申请/专利权人:上海市第一人民医院
申请日:2020-03-23
公开(公告)日:2024-04-02
公开(公告)号:CN111378741B
主分类号:C12Q1/6883
分类号:C12Q1/6883;C12N15/113
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.04.02#授权;2020.07.31#实质审查的生效;2020.07.07#公开
摘要:本发明提供了一种血液中环状RNA的检测方法及其应用。具体地,本发明提供了一种用于检测环状RNA分子的检测体系,所述体系包含:a一核酸探针;b一核酸外切酶;和c任选的待检测环状RNA分子;其中,当所述a中的核酸探针与所述c中的待检测环状RNA分子形成双链结构时,所述b中的核酸外切酶特异性地切割所述a中的Z4区域。本发明的检测体系和方法可以灵敏地检测出血液样品中是否含有目的环状RNA,并且可以准确地计算出血液中特定环状RNA的浓度。
主权项:1.一种用于检测环状RNA分子的检测体系,其特征在于,所述体系包含:a一核酸探针,所述的核酸探针为单链核酸探针,并且所述核酸探针从5’端至3’端具有如式I所示的结构,5’-Z1-Z2-Z3-Z4-Z5-3’式I其中,Z1为无或长度为1-5bp的核苷酸序列;Z2为与待检测的环状RNA分子反向互补的核苷酸序列;Z3为第一基团携带区;Z4为核酸外切酶识别区;Z5为第二基团携带区;所述Z3所携带的第一基团是淬灭基团,并且所述Z5所携带的第二基团是荧光基团;b一核酸外切酶,所述核酸外切酶可以特异性地识别所述Z4的核苷酸序列;和c任选的待检测环状RNA分子;其中,所述Z2中,与待检测的环状RNA分子反向互补的区域源自构成环状RNA闭环结构的两个不连续外显子与外显子之间互相连接的区域,或者源自构成环状RNA闭环结构的两个不连续内含子与内含子之间互相连接的区域;所述Z4为回文对称序列;当所述a中的核酸探针与所述c中的待检测环状RNA分子形成双链结构时,所述b中的核酸外切酶特异性地切割所述a中的Z4区域;并且,所述核酸外切酶不切割完全单链形式的核酸分子,且所述核酸外切酶特异性地切割具有部分双链结构的核酸分子。
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权利要求:
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