申请/专利权人:四川厌氧生物科技有限责任公司
申请日:2024-01-11
公开(公告)日:2024-04-09
公开(公告)号:CN117854602A
主分类号:G16B50/00
分类号:G16B50/00;G16B35/20;G16B20/30
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.26#实质审查的生效;2024.04.09#公开
摘要:本发明属于菌种筛选技术领域,具体涉及一种菌株入库保藏筛选方法。该方法包括步骤:S1.读取待入库菌株的16SrDNA的测序序列,获得质控结果;S2.根据质控结果和16SrDNA信息确定待入库菌株的菌种和或亚种信息,并确定菌库中已保藏的同菌种和或同亚种的菌株数量,当测序失败时则直接进入S3;S3.根据菌株数量和质控结果对待入库菌株标记优先级level,测序失败的菌株则标记特殊优先级;S4.结合每个菌株的分离源信息、菌株生长的OD值和步骤S3的优先级,确定各个待入库菌株是否筛选入库。该方法显著降低重复菌株被筛选入库的概率,提高入库效率和菌库质量,极大降低了成本。
主权项:1.一种菌株入库保藏筛选方法,包括以下步骤:S1.读取待入库菌株的16SrDNA的测序序列,并对其进行质量控制,获得质控结果;S2.当质控结果为测序成功或测序异常时,根据S1的16SrDNA信息确定待入库菌株的菌种和或亚种信息,并确定菌库中已保藏的同菌种和或同亚种的菌株数量N,当质控结果为测序失败时直接进入S3;S3.根据S2中确定的菌株数量N和质控结果对待入库菌株标记优先级level,测序成功时标记第一类优先级level,测序异常时标记第二类优先级level,在同一类优先级level中,菌株数量N越大,对应的待入库菌株的优先级越低,测序失败的菌株则标记特殊优先级level;S4.结合每个菌株的分离源信息、菌株生长的OD值和步骤S3的优先级level,确定各个待入库菌株是否筛选入库。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 四川厌氧生物科技有限责任公司 一种菌株入库保藏筛选方法
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