申请/专利权人:上海健康医学院;上海理工大学
申请日:2023-12-29
公开(公告)日:2024-04-05
公开(公告)号:CN117831622A
主分类号:G16B20/30
分类号:G16B20/30;G16B25/10;G16B30/10;G16B40/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开
摘要:本发明涉及PD‑L1阴性非小细胞肺癌靶点预测方法、介质及设备,所述方法包括以下步骤:获取待预测对象的降维基因信息,通过预先构建并训练的风险比例回归模型对所述降维基因信息进行处理,获得靶点预测结果;其中,降维基因信息通过以下步骤确定:从多源数据库中获取若干NSCLC患者的全基因组表达信息;针对每个数据库分别进行以下操作:进行预处理,生成PD‑L1阴性患者基因序列,进行基因初步筛选,获得癌变组织和正常组织之间的差异基因;构建加权基因共表达网络,提取与癌症发展相关度最高的模块;获得各数据库的交集基因;对交集基因进行降维处理。与现有技术相比,本发明有助于解决PD‑L1阴性NSCLC患者的免疫治疗应答效率低的问题,具有精度高、可靠性高等优点。
主权项:1.一种PD-L1阴性非小细胞肺癌靶点预测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取待预测对象的降维基因信息,通过预先构建并训练的风险比例回归模型对所述降维基因信息进行处理,获得靶点预测结果;其中,所述降维基因信息通过以下步骤确定:从多源数据库中获取历史数据,所述历史数据包括若干NSCLC患者的全基因组表达信息和正常数据;针对每个数据库分别进行以下操作:对所述历史数据进行预处理,生成PD-L1阴性患者基因序列,进行基因初步筛选,获得癌变组织和正常组织之间的差异基因;构建加权基因共表达网络,以所述差异基因作为输入,提取与癌症发展相关度最高的模块;对各数据库获得的所述模块内的基因信息进行取交集处理,获得交集基因;对所述交集基因进行降维处理,获得所述降维基因信息。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海健康医学院;上海理工大学 PD-L1阴性非小细胞肺癌靶点预测方法、介质及设备
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