申请/专利权人：粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)

申请日：2021-07-09

公开（公告）日：2024-04-12

公开（公告）号：CN113535326B

主分类号：G06F9/455

分类号：G06F9/455;G16B20/30;G16B50/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.12#授权;2021.11.09#实质审查的生效;2021.10.22#公开

摘要：本发明实施例提供一种基于高通量测序数据的计算流程调度系统，采用微服务架构，整合多种计算资源、Cromwell调度引擎，实现分析任务的有效调度，并在此基础上与App规范以及为App分发复用而定制开发的AppStore相结合，实现App的高效开发、测试、复用以及完成多组学数据的分析。通过Pipeline分析过程管理模块，将整个分析过程中涉及的参数和文件等通过版本控制工具，进行有效的管理，为后续项目溯源、Bug排查、数据分析复现等提供可靠的基础；极大简化了生物信息数据分析流程，实现了分析流程的可控，可复用，可溯源，应用场景较为广泛。

主权项：1.一种基于高通量测序数据的计算流程调度系统，其特征在于，包括计算层、调度层、管理层和应用层；所述计算层用于创建、管理目标项目所需的容器引擎、管理工具和存储库；所述调度层用于基于计算流程定义语言WDL的语言解析与任务调度引擎；所述管理层用于管理计算流程管理模块、作业管理模块、数据管理模块、通知管理模块、软件版本控制模块和溯源管理模块；所述应用层用于面向用户使用的操作界面与命令行；所述任务调度引擎连接所述管理层和所述计算层，进行目标项目相关业务流程的推进和过程监控，并对流程步骤的按时完成情况进行统计分析；所述计算流程管理模块、作业管理模块、数据管理模块、通知管理模块、软件版本控制模块和溯源管理模块均为计算流程封装成的应用程序App；具体地，确定WDL撰写和文件命名规范，结合模板语言将多组学数据计算流程封装成App并进行校验和版本控制；构建AppStore并集成完成封装的App，保证计算流程的可复用；通过简单的安装或卸载命令，完成指定版本App的安装和卸载；在使用App分析数据时，系统将所有输入通过模块渲染技术固化，并保存实际运行的脚本、参数、数据版本信息，实现计算的可重复性和可溯源性。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 粤港澳大湾区精准医学研究院(广州) 一种基于高通量测序数据的计算流程调度系统

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD