申请/专利权人：广东省农业科学院果树研究所

申请日：2023-07-25

公开（公告）日：2024-04-12

公开（公告）号：CN116855629B

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.12#授权;2023.10.27#实质审查的生效;2023.10.10#公开

摘要：本发明属于分子生物工程的技术领域，具体涉及一种用于判断荔枝种胚焦核性状的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记位于荔枝第3号染色体第17330407bp碱基，该处碱基为G或A，若该处碱基为G，基因型为GG，则判断荔枝种胚性状为大核或焦核率低且焦核性状不稳定的的品种，若该处碱基为A，基因型为GAAA则判断荔枝种胚性状焦核率高且焦核性状稳定的品种。通过利用荔枝资源的基因组重测序数据过滤后SNPs，进行连锁不平衡和全基因组关联分析，结合田间表型数据，定位到群体中焦核性状显著相关的SNP位点，继而利用KASP基因分型方法，开发出一种高效、通用、稳定的SNP分子标记。

主权项：1.一种用于判断荔枝种胚焦核性状的SNP分子标记的应用，其特征在于，所述SNP分子标记用于判断或辅助判断荔枝种胚发育类型性状；所述种胚性状包括稳定大核型、不稳定大核型焦核型、稳定焦核型；所述SNP分子标记位于荔枝第3号染色体第17330407bp碱基，该位点碱基为G或A，对应的基因型为GG、GA和AA三种基因型；若该位点基因型为GG，则判断荔枝种胚性状为大核或焦核率较低且焦核大核性状不稳定型；若该位点基因型为GA或AA，则判断荔枝焦核率高且焦核性状稳定型；扩增SNP分子标记所采用的引物对，其正向引物的核酸序列如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示，反向引物的核酸序列如SEQIDNO.3所示。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 广东省农业科学院果树研究所 一种用于判断荔枝种胚焦核性状的SNP分子标记及其应用

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