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【发明公布】基于癌细胞系多组学的药物反应预测方法及系统_中南大学_202410137112.5 

申请/专利权人:中南大学

申请日:2024-02-01

公开(公告)日:2024-04-30

公开(公告)号:CN117953997A

主分类号:G16C20/30

分类号:G16C20/30;G16C20/70;G06N3/045;G16B25/00;G16B20/50

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.05.17#实质审查的生效;2024.04.30#公开

摘要:本发明公开了一种基于癌细胞系多组学的药物反应预测方法,包括获取已知的癌细胞系数据信息、药物数据信息和对应的反应信息并预处理;计算癌细胞系的通路富集分数和药物的分子指纹并构建训练数据集;构建药物反应预测初始模型并训练得到药物反应预测模型;采用药物反应预测模型进行实际的药物反应预测。本发明还公开了一种实现所述基于癌细胞系多组学的药物反应预测方法的系统。本发明充分利用了癌细胞系的多种组学信息、通路富集信息和药物的分子指纹得到癌细胞系和药物的表征向量,从而利用双线性注意力网络得到癌细胞系和药物的融合表征并最终完成预测;因此本发明的可靠性更高,而且精确性更好。

主权项:1.一种基于癌细胞系多组学的药物反应预测方法,包括如下步骤:S1.获取已知的癌细胞系数据信息、药物数据信息和对应的反应信息;S2.对步骤S1获取的数据信息进行预处理;S3.基于步骤S2得到的预处理后的数据,计算癌细胞系的通路富集分数和药物的分子指纹,并构建训练数据集;S4.基于多层感知机和双线性注意力网络,构建药物反应预测初始模型;S5.采用步骤S3得到的训练数据集,对步骤S4构建的药物反应预测初始模型进行训练,得到药物反应预测模型;S6.采用步骤S5得到的药物反应预测模型,进行实际的药物反应预测。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中南大学 基于癌细胞系多组学的药物反应预测方法及系统

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