申请/专利权人:上海韦翰斯生物医药科技有限公司
申请日:2020-09-22
公开(公告)日:2024-04-30
公开(公告)号:CN114250279B
主分类号:C12Q1/6858
分类号:C12Q1/6858
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.04.30#授权;2022.04.15#实质审查的生效;2022.03.29#公开
摘要:本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及一种单倍型的构建方法,所述构建方法包括以下步骤:针对目的基因设计多对PCR引物,以使扩增后相邻两条PCR产物具有重叠区域,且所有PCR产物能完全覆盖目的基因;利用设计的PCR引物扩增目的基因;以扩增得到的所有PCR产物为模板进行长读长二代测序文库构建并上机测序;数据分析:通过组装获得目的基因的单倍型信息。可以利用现有的长读长二代测序技术实现目标区域的靶向单倍型检测,极大地提高现有的长读长二代测序技术的应用范围;此外,也在靶向测序领域实现了单倍型检测的可能;以更低的成本实现靶向基因组单倍型检测,且准确率达到了100%。
主权项:1.一种单倍型的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:1)针对目的基因设计多对PCR引物,以使扩增后相邻两条PCR产物具有重叠区域,且所有PCR产物能完全覆盖目的基因;2)利用步骤1)的PCR引物扩增目的基因;3)以扩增得到的所有PCR产物为模板进行长读长二代测序文库构建并上机测序;4)数据分析获得目的基因的单倍型信息;步骤1)中设计PCR引物所针对的目的基因包括:目的基因的基因组区域及基因组上下游各10~200kb的区域;步骤1)中每一对引物扩增的PCR产物的理论长度至少为17kb;所述步骤3)中长读长二代测序文库通过TELL-Seq技术构建;上机测序的平台选自二代测序平台;步骤1)中相邻两条PCR产物有1~10kb的重叠区域。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司 一种单倍型的构建方法
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