申请/专利权人:中国水产科学研究院珠江水产研究所;广州锐沣渔业发展有限公司
申请日:2020-11-18
公开(公告)日:2021-02-23
公开(公告)号:CN112391481A
主分类号:C12Q1/6888(20180101)
分类号:C12Q1/6888(20180101);C12Q1/6858(20180101);C12N15/11(20060101)
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2021.08.17#授权;2021.03.12#实质审查的生效;2021.02.23#公开
摘要:本发明公开了鉴别尖塘鳢鱼种的SNPs及基于SNPs的AS‑PCR引物组及其检测方法与应用。所述SNP标记位于如SEQIDNO.1所示序列中。本发明基于得到的SNPs位点转化成AS‑PCR标记,利用AS‑PCR鉴别三种尖塘醴,本发明中的检测方法操作简便、耗时短、成本低;而且设计得到的AS‑PCR引物组灵敏度高,P2引物在模板中可稀释到10‑4倍,P3引物在模板中可稀释到10‑3倍,具有极高的应用价值。
主权项:1.SNP标记在尖塘鳢鱼种鉴别中的应用,其特征在于,所述SNP标记位于如SEQIDNO.1所示序列中;其中,所述SEQIDNO.1所示序列自5’端起,第77位测序峰图为单峰且碱基为G判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为GC判定为杂交尖塘醴;和或第238位测序峰图为单峰且碱基为T判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为TC判定为杂交尖塘醴;和或第320位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CA判定为杂交尖塘醴;和或第333位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CA判定为杂交尖塘醴;和或第345位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为T判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CT判定为杂交尖塘醴;和或第371位测序峰图为单峰且碱基为G判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为GA判定为杂交尖塘醴;和或第403位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AC判定为杂交尖塘醴;和或第429位测序峰图为单峰且碱基为T判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为TC判定为杂交尖塘醴;和或第449位测序峰图为单峰且碱基为T判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为TA判定为杂交尖塘醴;和或第478位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为T判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CT判定为杂交尖塘醴;和或第516位测序峰图为单峰且碱基为G判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为GC判定为杂交尖塘醴;和或第547位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CG判定为杂交尖塘醴;和或第563位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CG判定为杂交尖塘醴;和或第569位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AG判定为杂交尖塘醴;和或第629位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AC判定为杂交尖塘醴;和或第670位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AG判定为杂交尖塘醴;和或第674位测序峰图为单峰且碱基为C判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为CA判定为杂交尖塘醴;和或第701位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AG判定为杂交尖塘醴;和或第787位测序峰图为单峰且碱基为G判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为A判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为GA判定为杂交尖塘醴;和或第793位测序峰图为单峰且碱基为A判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为G判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为AG判定为杂交尖塘醴;和或第822位测序峰图为单峰且碱基为T判定为云斑尖塘鳢、为单峰且碱基为C判定为线纹尖塘鳢,为双峰且碱基为TC判定为杂交尖塘醴。
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