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【发明授权】一种同时检测新冠肺炎康复者恢复期血浆中SARS-CoV-2病毒及其他病原体的方法_国药集团武汉血液制品有限公司_202010514140.6 

申请/专利权人:国药集团武汉血液制品有限公司

申请日:2020-06-08

公开(公告)日:2021-09-17

公开(公告)号:CN111549183B

主分类号:C12Q1/70(20060101)

分类号:C12Q1/70(20060101);C12Q1/689(20180101);C12Q1/686(20180101);C12Q1/04(20060101)

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2021.09.17#授权;2020.09.11#实质审查的生效;2020.08.18#公开

摘要:本发明涉及一种同时检测新冠肺炎康复者恢复期血浆中SARS‑CoV‑2病毒及其他病原体的方法,所述的方法使用的反应体系包括:1检测SARS‑CoV‑2病毒的引物组,2检测多种其他病原体的检测引物组,3必要的核酸提取试剂及显色试剂;4内部质控核酸样本、扩增质控、阳性质控。所述的同时检测新冠肺炎康复者恢复期血浆中SARS‑CoV‑2病毒及呼吸道病原体为:经过一次核酸提取后,样本进行两次实时荧光PCR检测,分别确定样本中的SARS‑CoV‑2病毒和多种病原微生物。

主权项:1.一种同时检测血浆样品中SARS-CoV-2病毒、和多种其他病原体的检测试剂盒,所述的试剂盒包括:1检测SARS-CoV-2病毒的引物组,2检测多种其他病原体的检测引物组,3必要的核酸提取试剂及显色试剂;所述的检测SARS-CoV-2病毒的引物组为如下两组荧光PCR引物组:SARS-CoV-2靶标一orf1ab:TEXASRED610-BHQ2荧光信号组SEQIDNO.1:正向引物F:CCCTGTGGGTTTTACACTTAASEQIDNO.2:反向引物R:ACGATTGTGCATCAGCTGASEQIDNO.3:荧光探针P:CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG,且该探针5'端为TEXASRED610,3'端为BHQ2;SARS-CoV-2靶标二N:FAM-BHQ1荧光信号组SEQIDNO.4:正向引物F:GGGGAACTTCTCCTGCTAGAATSEQIDNO.5:反向引物R:CAGACATTTTGCTCTCAAGCTGSEQIDNO.6:荧光探针P:TTGCTGCTGCTTGACAGATT,且该探针5'端为FAM,3'端为BHQ1;所述的检测多种其他病原体的引物组为1ROX-BHQ1荧光信号组呼吸道合胞病毒A型引物组:SEQIDNO.7:正向引物F:TGATACACTCAACAAAGATCAACTTCTGSEQIDNO.8:反向引物R:TCTCCTGTGCTCCGTTGGATSEQIDNO.9:荧光探针P:CATCCAGCAAATACAC,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;腺病毒引物组:SEQIDNO.10:正向引物F:ATGGCCACCCCTTCGATGASEQIDNO.11:反向引物R:CCCGGACTCAGGTACTCCGASEQIDNO.12:荧光探针P:TACATGCACATCGCCGG,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;人偏肺病毒引物组:SEQIDNO.13:正向引物F:GCAACATGAAATAATGAAGAATGTACACSEQIDNO.14:反向引物R:GAGTGCTAATGTTTTTACTCCTCGTTAASEQIDNO.15:荧光探针P:TGAGCTCACACTATTGAA,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;呼吸道合胞病毒B型引物组:SEQIDNO.16:正向引物F:GCTTGATGTCAGTTGTGGAACAATSEQIDNO.17:反向引物R:TGTATCTCATTCAGCTTCGGTATGASEQIDNO.18:荧光探针P:CACAAACATATGTCCTAATAGA,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;甲型流感病毒引物组:SEQIDNO.19:正向引物F:CTGGGAATGCTGAAATTGAAGATCSEQIDNO.20:反向引物R:TCATATCCACTGGCCACGGCAAGSEQIDNO.21:荧光探针P:CCTGAGAGGATCAGTGGCCCACAAGT,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;乙型流感病毒引物组:SEQIDNO.22:正向引物F:CCAGGGATTGCAGACATTGAAGASEQIDNO.23:反向引物R:TGGCTTCGTACCCAACCATAGAGTACTSEQIDNO.24:荧光探针P:TCGTTGTTAGGCCCTCTGTGGCG,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;副流感病毒1型引物组:SEQIDNO.25:正向引物F:ACCCGAAATGACAATTCCSEQIDNO.26:反向引物R:GGATCATGATAATGAAGGACAASEQIDNO.27:荧光探针P:TACACCAGCAGGAAGGACACA,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;副流感病毒2型引物组:SEQIDNO.28:正向引物F:CCAACTATCGATTTGCTGSEQIDNO.29:反向引物R:ATCCGGTAGTATTTAGTAGGSEQIDNO.30:荧光探针P:AATGAGTCCAACCGAACCAATCC,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;副流感病毒3型引物组:SEQIDNO.31:正向引物F:ACCAGGAAACGATGAATGSEQIDNO.32:反向引物R:GGGTTCACTCTCGATTTCSEQIDNO.33:荧光探针P:AGTATGACAGATGACACAATGCTCC,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;副流感病毒4型引物组:SEQIDNO.34:正向引物F:GGTACAATTGCTCTTGGTGSEQIDNO.35:反向引物R:ACTGCCTCATTTGTTTCTGSEQIDNO.36:荧光探针P:ACAAGTTACAGCAGCAATCGGTC,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;博卡病毒引物组:SEQIDNO.37:正向引物F:GGAGAGGAAGAGACACTGSEQIDNO.38:反向引物R:GGTGTTCCTGATGATATGAGSEQIDNO.39:荧光探针P:TCATCACAGGAGCAGGAGCC,且该探针5'端为ROX,3'端为BHQ1;2Cy5-BHQ2荧光信号组嗜肺军团杆菌引物组:SEQIDNO.40:正向引物F:TCCTAGTAGTGAAGATGAATGTAATGATGTSEQIDNO.41:反向引物R:AACTTAATATGAGATTTTCCCGCTGCCAACAASEQIDNO.42:荧光探针P:TGCTGCGGTACCCTGCGATTC,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;百日咳鲍特菌引物组:SEQIDNO.43:正向引物F:GGCATCAAGCACCGCTTTAC-SEQIDNO.44:反向引物R:CGGTGTTGGGAGTTCTGSEQIDNO.45:荧光探针P:CGTGCCTGACTACTAGT,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;鼻病毒引物组:SEQIDNO.46:正向引物F:AGACCAATAGTAGGCAACSEQIDNO.47:反向引物R:CCTACTAAGCTCTGTGTASEQIDNO.48:荧光探针P:TCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCAC,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;肠病毒引物组:SEQIDNO.49:正向引物F:CGAACTCAGCATCAGAAGSEQIDNO.50:反向引物R:TCTCGTGTATGACATCCASEQIDNO.51:荧光探针P:ACTACACCACCATCAACTATTACAACG,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;肺炎衣原体引物组:SEQIDNO.52:正向引物F:TGAAGTCGGAATTGCTAGTAATGGSEQIDNO.53:反向引物R:GTGTGTACAAGGCCCGAGAACSEQIDNO.54:荧光探针P:TGTCAGCCATAACGCCGTGAAT,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;肺炎支原体引物组:SEQIDNO.55:正向引物F:GGGAGGCAGCAGTAGGGAATSEQIDNO.56:反向引物R:ACAATCTTAAAGACCTTCATCGTTCASEQIDNO.57:荧光探针P:TTTTTCACAATGAGCGAAAGCTTGATGGA,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;冠状病毒OC43引物组:SEQIDNO.58:正向引物F:GCCTATCAACAACAAGATGSEQIDNO.59:反向引物R:GCAACACTTATATTATCATTTTCTCSEQIDNO.60:荧光探针P:CTTATGACCACGCTGACGCTG,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;冠状病毒NL63引物组:SEQIDNO.61:正向引物F:GTCGTTCTTCAACTCGTAASEQIDNO.62:反向引物R:AAGCCAAAGTAACAGCAGSEQIDNO.63:荧光探针P:CTTCTCGTAGCACTTCAAGACAACAG,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;冠状病毒HKU1引物组:SEQIDNO.64:正向引物F:AGCTGACACTTCTACTCCSEQIDNO.65:反向引物R:GAACCTGGTCGACTATTAGSEQIDNO.66:荧光探针P:AGACCTTCCTGAGCCTTCAACAT,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;冠状病毒C229E引物组:SEQIDNO.67:正向引物F:GTGGATTTGTCACCCAAGSEQIDNO.68:反向引物R:CCTGTAGGTTCAGTTTTAGCSEQIDNO.69:荧光探针P:CAGACGACACCTTCAACACGC,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;HIN1引物组:SEQIDNO.70:正向引物F:GTGGATTTGAGATGATTTGSEQIDNO.71:反向引物R:GCAGTTCATTCCTGTTAASEQIDNO.72:荧光探针P:AACTTCCACTGTATCCTGACCAATCA,且该探针5'端为Cy5,3'端为BHQ2;所述的同时检测SARS-CoV-2病毒和多种病原微生物为,经过一次核酸提取后,样本进行两次实时荧光PCR检测,分别确定样本中的SARS-CoV-2病毒和多种病原微生物;所述的试剂盒还包括,4必要的样本提取内部质控核酸样本,所述的内部质控核酸样本用于同时对SARS-CoV-2病毒的样本检测和多种病原微生物样本的检测进行质量监控,确定PCR反应前,提取核酸样本的过程没有系统错误;所述的内部质控核酸样本为含有一段HIV-1目的基因RNA片段的MS2噬菌体;在对待测血浆进行预处理时,使用蛋白酶K裂解血浆样本后,即加入内部质控核酸样本;5用于检测多个荧光通道是否能够正常显色的AC扩增质控,所述的AC扩增质控核酸在样本核酸提取完毕后,进行PCR扩增前加入。

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