申请/专利权人:上海诚明融鑫科技有限公司
申请日:2023-06-14
公开(公告)日:2023-10-03
公开(公告)号:CN116844639A
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G16B50/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2023.10.24#实质审查的生效;2023.10.03#公开
摘要:本发明涉及DNA搜索领域,公开了一种具有自适应学习控制能力的人类mtDNA快速比对方法及装置,其中,所述方法包括:将mtDNA划分为多个一级子库,并对所述一级子库进一步划分为二级子库,每入库一个样本,进行自适应排序,形成数据库;所述数据库建立完成后,计算待比对mtDNA的总长度,根据总长度选取所述待比对mtDNA对应的一级子库;计算所述待比对mtDNA与标准序的差异序,同时确认所述待比对mtDNA的基因座值和差异数量总和值,根据所述差异数量总和值选取二级子库;按照自适应排序确定的优先级,将所述待比对mtDNA的基因座值与数据库内mtDNA的基因座值进行比对;本发明的一个方面可以排除大量的无意义比对,自适应控制比对顺序,在较大库容的情况下快速进行人类mtDNA搜索。
主权项:1.一种具有自适应学习控制能力的人类mtDNA快速比对方法,包括如下步骤:将mtDNA划分为多个一级子库,并对所述一级子库进一步划分为二级子库,每入库一个样本,进行自适应排序,形成数据库;所述数据库建立完成后,计算待比对mtDNA的总长度,根据总长度选取所述待比对mtDNA对应的一级子库;计算所述待比对mtDNA与标准序的差异序,同时确认所述待比对mtDNA的基因座值和差异数量总和值,根据所述差异数量总和值选取二级子库;按照自适应排序确定的优先级,将所述待比对mtDNA的基因座值与数据库内mtDNA的基因座值进行比对。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海诚明融鑫科技有限公司 一种具有自适应学习控制能力的人类mtDNA快速比对方法及装置
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