申请/专利权人：西北农林科技大学

申请日：2023-04-12

公开（公告）日：2023-10-10

公开（公告）号：CN116864009A

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B15/30;G16B20/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.10.27#实质审查的生效;2023.10.10#公开

摘要：本发明提供了一种基于转录组学结合蛋白组DIA研究锶对奶牛亚急性瘤胃酸中毒靶基因的预测方法。本发明包括以下步骤1通过转录组数据，揭示奶牛亚急性瘤胃酸中毒的分子机制；2蛋白组学DIA数据，分析锶对亚急性瘤胃上皮细胞的影响；3转录组学和蛋白组学的关联分析，筛选了锶对奶牛瘤胃酸中毒靶基因的预测。本发明利用转录组学和蛋白组学技术筛选锶对奶牛瘤胃酸中毒影响的靶基因，为锶在奶牛代谢性疾病的早期干预及综合防控中的应用奠定理论基础。

主权项：1.一种基于转录组学结合蛋白组学DIA研究锶对奶牛亚急性瘤胃酸中毒影响的靶基因预测方法，其特征在于，包括：从NCBIGEO数据获取高精饲料诱导亚急性瘤胃酸中毒的奶牛瘤胃样本的转录组原始数据；提取锶处理奶牛瘤胃上皮细胞的总蛋白并进行定量，然后依次酶解、高PH反相分离、EASY-nLC1200色谱系统的进行质谱数据采集，质谱数据采用Spectronaut进行分析；分别对转录组测序和蛋白组学DIA数据进行数据分析，并采用关联分析将转录组中的差异的基因关联到蛋白组中，筛选到锶对奶牛瘤胃酸中毒影响的调控蛋白和相应的基因，并对基因进行GO和KEGG富集分析，即得。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 西北农林科技大学 一种基于转录组学结合蛋白组学DIA研究锶对奶牛亚急性瘤胃酸中毒影响的靶基因预测

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