申请/专利权人：华东交通大学

申请日：2023-11-03

公开（公告）日：2024-01-19

公开（公告）号：CN117423389A

主分类号：G16B40/20

分类号：G16B40/20;G16B5/20;G06N3/042;G06N3/045;G06N3/09

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.02.06#实质审查的生效;2024.01.19#公开

摘要：本发明公开了一种基于图注意力随机游走的疾病关联circRNA预测方法，该方法首先构建circRNA‑疾病二分关联网络，然后基于二分关联网络分别计算circRNA和疾病节点的高斯核相似性，最后利用图注意力机制来引导随机游走以预测疾病与circRNA之间关联度。本发明在随机游走过程中基于自注意力赋予邻居节点不同的游走概率，用于引导下一步优先游走的节点。对比实验结果表明，该方法能够较准确地预测潜在的疾病关联circRNA，具有良好的预测性能。

主权项：1.一种基于图注意力随机游走的疾病关联circRNA预测方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤S1：根据circRNA与疾病之间关联信息，构建circRNA-疾病二分关联网络；步骤S2：利用步骤S1中的circRNA-疾病二分关联网络，分别计算circRNA节点之间的高斯核相似性和疾病节点之间的高斯核相似性，得到节点的初始特征；步骤S3：利用图注意力机制，根据节点初始特征映射后的特征，利用图注意力机制计算得到相邻节点间的游走概率；步骤S4：构建待查询疾病节点的关联概率向量，并基于游走概率对关联概率向量初始化；所述关联概率向量是指待查询疾病节点与所有节点之间的关联概率，维度为m+n，m和n分别为疾病节点和circRNA节点的数量；疾病节点自身的关联概率初始值设置为1，疾病节点到相邻的circRNA节点间的关联概率初始值为疾病节点到相邻的circRNA节点间的游走概率，疾病节点到其余节点间的关联概率初始值设置为0；步骤S5：在circRNA-疾病二分关联网络上，从待查询疾病节点出发，依据游走概率，迭代地进行重启随机游走直至待查询疾病节点到所有节点的关联概率向量收敛，以待查询疾病节点到每个未知关联的circRNA节点的关联概率作为对应各未知关联的circRNA节点与待查询疾病节点之间的关联得分，按得分大小排序，实现疾病关联circRNA预测。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 华东交通大学 基于图注意力随机游走的疾病关联circRNA预测方法

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