申请/专利权人：南通大学

申请日：2023-10-13

公开（公告）日：2024-02-02

公开（公告）号：CN117487946A

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12N15/60;G16B25/10

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.02.23#实质审查的生效;2024.02.02#公开

摘要：本发明属于生物技术领域，公开了一种棉酚生物合成调控代谢基因的发掘方法及应用。本发明以中棉所12有腺体CRG和中棉所12无腺体CRL为材料，对其开展转录组测序分析鉴定差异表达基因；然后通过加权基因共表达网络分析找到与棉酚含量性状高度正相关的模块；对模块的枢纽基因进行RT‑qPCR表达分析，找到有腺体棉花叶片中的表达最高且在无腺棉花叶片上的表达较低的基因GH_D05G2016。该基因为棉酚生物合成调控代谢基因，该基因可用于调控棉花腺体数量或调节棉花棉酚性状。

主权项：1.一种棉酚生物合成调控代谢基因的发掘方法，其特征在于，包括以下步骤：S1.转录组测序分析：以一对近等基因系为材料构建6个转录组文库开展转录组测序分析，并通过基因表达的DESeq差异分析鉴定差异表达基因；所述一对近等基因系为中棉所12有腺体CRG和中棉所12无腺体CRL；S2.加权基因共表达网络分析：通过使用所述近等基因系中共表达所述差异表达基因的FPKM值进行加权基因共表达网络分析，找到与棉酚含量性状高度正相关的模块作为目标分析模块，所述目标分析模块与棉酚含量性状的相关系数最大；S3.RT-qPCR表达分析：确定所述目标分析模块的枢纽基因，对各个所述枢纽基因开展RT-qPCR表达分析，找到有腺体棉花叶片中的表达最高且在无腺棉花叶片上的表达较低的基因，该基因即为棉酚生物合成调控代谢基因。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 南通大学 一种棉酚生物合成调控代谢基因的发掘方法及应用

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