申请/专利权人：中国人民解放军空军军医大学

申请日：2023-12-22

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN117746977A

主分类号：G16B20/00

分类号：G16B20/00;G01N27/447;G01N33/68

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.03.22#公开

摘要：本发明公开了一种蛋白质定量和差异分析方法，属于蛋白质分析技术领域，可以实现在遗传学层面上，可使用反向遗传学的方法，如knockdown，knockout，CRISPR等，观察基因改变后导致的表型变化，并结合目的基因回补实验，进一步证实目的蛋白与表型之间的关联，且在细胞生物学层面上，一方面可通过敲除目的蛋白或引入目的蛋白的过表达突变体，在表型变化的层面上，观察目的蛋白表达水平改变或修饰水平的改变对细胞周期、细胞增殖、迁移、极性、凋亡以及细胞间通讯等过程的影响；另一方面可利用免疫荧光、FRET等荧光标记手段对目标分子的亚细胞定位和实时动态变化进行分析，为功能机制的研究和蛋白质相互作用提供依据。

主权项：1.一种蛋白质定量和差异分析方法，其特征在于：包括以下步骤：S1、首先提取原始样本中的蛋白质，并将提取的蛋白质在数据库中进行检索和比对；S2、将S1中的蛋白质酶解为肽段，并通过凝胶电泳、质谱等技术获取肽段的海量数据，并依据这些数据对蛋白质进行鉴定，获取蛋白质鉴定效果；S3、根据蛋白质鉴定效果进行蛋白定量分析，并筛选出差异表达蛋白质，对其数量进行统计；S4、在功能注释过程中，采用Blast2Go软件对所有差异表达蛋白质进行GO功能，同时，在GO二级功能注释层级上对差异蛋白数目进行统计，接着进行GO功能注释的显著性富集分析；S5、在功能注释过程中，对显著性差异表达的蛋白质进行KEGG通路注释，并进行KEGG通路富集分析，同时分析差异蛋白质的功能结构域，并对差异蛋白结构域注释结果进行富集分析。S6、然后使软件WoLFPSORT对差异蛋白质进行亚细胞定位分析，并采用聚类分析的方法对数据进行分组和归类；S7、利用转录因子对差异蛋白质进行深入分析，接着通过相互作用网络分析结果。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国人民解放军空军军医大学 一种蛋白质定量和差异分析方法

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