申请/专利权人:深圳赛陆医疗科技有限公司
申请日:2024-01-18
公开(公告)日:2024-04-09
公开(公告)号:CN117854594A
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G06K7/10
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.26#实质审查的生效;2024.04.09#公开
摘要:本申请提供一种测序定位匹配方法及装置、空间组学测序设备及介质,测序定位匹配方法包括:获取带有空间位置信息的第一位置条码,构建第一位置条码的索引信息库,获取二次测序获得的第二位置条码,针对每一第二位置条码,获取多个待选短序列,将待选短序列与索引信息库进行比对确定匹配短序列,构建匹配短序列与第一位置条码的匹配信息库,根据匹配信息库,确定第一位置条码的比对优先级,针对每一第二位置条码,将其与第一位置条码按照比对优先级进行比对,确定与第二位置条码的编辑距离满足目标要求的候选第一位置条码,基于候选第一位置条码的空间位置信息计算空间距离,基于空间距离满足目标条件确定比对成功的第二位置条码。
主权项:1.一种空间组学的测序定位匹配方法,其特征在于,包括:获取带有空间位置信息的第一位置条码;针对每一所述第一位置条码,获取多个参考短序列,根据各所述参考短序列所在第一位置条码的序号和位置建立索引信息,构建所述第一位置条码的索引信息库;获取二次测序获得的第二位置条码;针对每一所述第二位置条码,获取多个待选短序列,将所述待选短序列与所述索引信息库进行比对确定匹配短序列,构建所述匹配短序列与所述第一位置条码的匹配信息库;根据所述匹配信息库,确定所述第一位置条码的比对优先级;针对每一所述第二位置条码,将其与所述第一位置条码按照所述比对优先级进行比对,确定与所述第二位置条码的编辑距离满足目标要求的候选第一位置条码,基于所述候选第一位置条码的所述空间位置信息计算空间距离,基于所述空间距离满足目标条件确定比对成功的第二位置条码。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 深圳赛陆医疗科技有限公司 测序定位匹配方法及装置、空间组学测序设备及介质
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