申请/专利权人：武汉明德生物科技股份有限公司

申请日：2023-12-21

公开（公告）日：2024-04-12

公开（公告）号：CN117877579A

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30;G16B25/20;G16B50/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.30#实质审查的生效;2024.04.12#公开

摘要：本发明公开了一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法，具体为：基于各病原微生物基因组上靶向区域设计的引物进行多重扩增，扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序，将测序结果比对至针对病原微生物靶向区域构建的索引文件上，并对比对后的文件进行特定的过滤处理，根据过滤后测序结果比对至靶向区域的reads数，获得病原微生物的检出情况。通过本发明方法，可以有效减少测序结果中嵌合体等数据的干扰，从而提升病原微生物检出的准确性。

主权项：1.一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、基于各病原微生物基因组靶向区域设计的引物进行多重扩增，扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序，其中所述靶向区域具有保守性和特异性；S2、针对步骤S1所述靶向区域构建索引文件，所述索引文件中包括靶向区域与病原微生物物种信息的对应关系；S3、将测序结果比对至索引文件上，并对比对后的文件进行过滤处理。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 武汉明德生物科技股份有限公司 一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法

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