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【发明公布】一种应用对比学习充分融合特征用于药物-靶标关联预测方法_中国石油大学(华东)_202410055602.0 

申请/专利权人:中国石油大学(华东)

申请日:2024-01-15

公开(公告)日:2024-04-12

公开(公告)号:CN117877570A

主分类号:G16B15/30

分类号:G16B15/30;G16B40/00;G16C20/50;G06F16/901;G06F18/22;G06F18/25;G06N3/0499;G06N3/084;G06N3/0895

优先权:

专利状态码:在审-公开

法律状态:2024.04.12#公开

摘要:本发明提供了一种应用对比学习充分融合特征用于药物‑靶标关联预测方法,涉及生物信息学、深度学习以及关联预测领域。首先,我们整合并下载相关药物‑靶标关联作为初始数据,利用靶标和药物作为超边分别构建药物超图和靶标超图。然后,基于构建的药物超图和靶标超图提取药物‑药物相似性信息和靶标‑靶标相似性信息,并利用对比学习的方法将其与药物‑靶标关联图结构信息充分融合到药物特征和靶标特征。最终将充分融合的药物特征与靶标特征拼接作为药物‑靶标特征表示,输入到全连接神经网络中实现药物‑靶标关联预测任务。使用自适应矩估计反向传播优化算法优化整体模型参数,通过不断迭代提升药物‑靶关联预测的准确率。

主权项:1.一种应用对比学习充分融合特征用于药物-靶标关联预测方法,包括以下部分:A、基于已知药物-靶标相互作用关联构建药物超图和靶标超图。B、基于药物超图和靶标超图,进一步构建基于超图的药物-药物相似性和靶标-靶标相似性,利用对比学习方法分别获取药物和靶标的特征表示。C、基于全连接神经网络实现对药物-靶标关联预测。D、基于自适应矩估计反向传播优化算法训练参数。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国石油大学(华东) 一种应用对比学习充分融合特征用于药物-靶标关联预测方法

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