申请/专利权人：苏州立妙达药物科技有限公司

申请日：2022-10-26

公开（公告）日：2024-04-23

公开（公告）号：CN115631784B

主分类号：G16B15/30

分类号：G16B15/30

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.23#授权;2023.02.14#实质审查的生效;2023.01.20#公开

摘要：本申请提供一种基于多尺度判别的无梯度柔性分子对接方法，包括步骤：S1，准备受体分子和配体分子的3D数据，对受体分子和配体分子进行预处理；S2，对预处理后的分子进行结构图数据化，得到统一的分子的描述子，再对所述描述参数进行归一化处理；S3，对预处理后的分子或和归一化后的描述参数采用随机突变模块进行结合模拟及随机突变，获得突变后的描述参数；S4，突变后的描述参数输入优化模块，优化模块采用搜索模块和打分模块进行搜索和匹配度打分，终止条件模块判断打分分数符合终止条件，则得到打分最优的分子描述参数。

主权项：1.一种基于多尺度判别的无梯度柔性分子对接方法，其特征在于，包括步骤：S1，准备受体分子和配体分子的3D数据，对受体分子和配体分子进行预处理；S2，对预处理后的配体分子或和受体分子进行结构图数据化，得到统一的配体分子或和受体分子的描述子，再对描述参数进行归一化处理；S3，对S1中预处理后的分子或和S2中归一化后的描述参数采用随机突变模块进行结合模拟并对描述参数进行随机突变，获得突变后的描述参数，参数模块根据迭代次数随机给出此次突变所需的突变个数，最大突变个数为描述参数的个数，所需的突变个数为1到最大突变个数之间的任意整数值；再根据所需的突变个数对描述参数进行修改，在所有描述参数中随机选择所述所需的突变个数的描述参数进行修改改变，描述参数进行改变的值的范围也在0-1之间；S4，将突变后的描述参数输入优化模块，优化模块包括搜索模块、打分模块和终止条件模块，采用搜索模块和打分模块进行搜索和匹配度打分，终止条件模块判断打分分数符合终止条件，则得到打分最优的分子描述参数，（a）所述搜索模块包括描述子单元和无梯度算法单元，将突变后的描述参数输入描述子单元，描述子单元对突变后的描述参数进行处理后输出N个描述参数到打分模块进行受体分子与配体分子的匹配度打分，得到初步打分分数，N≥1；（b）将初步打分分数输入无梯度算法单元进行无梯度计算得到无梯度计算结果；（c）无梯度算法单元将计算结果输入打分模块进行打分，打分分数回到无梯度算法单元再次进行计算，计算结果输入终止条件模块进行判断是否符合终止条件，若不符合终止条件循环（c）直到符合终止条件，所述终止条件模块将打分分数最小值和描述子变化率绝对值与参数模块设定的打分分数最小值阈值和描述子变化率绝对值阈值进行比较，若小于打分分数最小值阈值和描述子变化率绝对值阈值，则第一条件合格；终止条件模块还将压缩后的描述子值和N个描述子均值的差的绝对值与参数模块设定的压缩后的描述子值阈值和N个描述子均值的差的绝对值阈值进行比较，若小于压缩后的描述子值阈值和N个描述子均值的差的绝对值阈值，则第二条件合格；终止条件模块还将内循环次数与参数模块设定的内循环次数阈值进行比较，内循环次数达到内循环次数阈值，则第三条件合格；只要其中一个条件合格，则符合终止条件。

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权利要求：

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