申请/专利权人：祥符实验室

申请日：2023-12-20

公开（公告）日：2024-04-16

公开（公告）号：CN117887817A

主分类号：C12Q1/682

分类号：C12Q1/682

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.04.16#公开

摘要：本发明提供一种基于催化发夹自组装检测微量核酸序列完整度的方法及应用，该方法包括以下步骤：S1：构建特异性探针H0、通用探针H1和H2，退火得到发夹结构；S2：指示荧光探针的合成；S3：将target序列与两端分别缺失不同碱基数目的target序列同多种发夹结构、指示荧光探针共孵育，触发有效的CHA反应；S4：通过酶标仪测定不同体系的荧光强度来评估target序列的完整性；S5：根据多种发夹结构的分辨率差异对探针H0的设计进行进一步的评估。根据本发明提供的检测方法，可以很好地检测微量核酸序列的碱基缺失程度，仅需改变探针的识别序列，即可适用于任意核酸片段的完整性检测，具有良好的生物医学应用前景。

主权项：1.一种基于催化发夹自组装检测微量核酸序列完整度的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：发夹的自组装：分别构建特异性探针H0、通用探针H1和H2，将H0、H1、H2进行退火得到H0-H1-H2发夹结构；其中，所述特异性探针H0的茎部包括4个碱基错配，使之在不泄露的情况下对target序列的碱基缺失更加敏感，所述特异性探针H0的环部具有与target序列两端互补配对的序列，通过调控与target序列互补区域的长度设计不同长度的环部，以实现碱基缺失个数的高分辨率；S2：指示荧光探针的合成；S3：将完整的target序列与两端分别缺失不同碱基数目的target序列同多种H0-H1-H2发夹结构、指示荧光探针共孵育，触发有效的CHA反应；其中，以缺失不同碱基个数的target序列模拟复杂环境体系中完整target序列的降解程度；S4：通过酶标仪测定缺失不同碱基数目的target序列体系的荧光强度来评估target序列的片段完整性；S5：根据多种H0-H1-H2发夹结构识别缺失碱基的target序列的分辨率差异对探针H0的设计进行进一步的评估。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 祥符实验室 一种基于催化发夹自组装检测微量核酸序列完整度的方法及应用

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