申请/专利权人：人和未来生物科技(长沙)有限公司

申请日：2022-11-16

公开（公告）日：2023-03-21

公开（公告）号：CN115827221A

主分类号：G06F9/50

分类号：G06F9/50;G06F16/174

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.04.07#实质审查的生效;2023.03.21#公开

摘要：本发明公开了一种BAM文件并行读取方法、系统及介质，本发明从待解析BAM文件中顺序读取压缩数据块，将上述压缩数据块按照预设规则进行分组，生成由分组压缩块组成的待解压队列；读取线程以分组压缩块为单位，并行从待解压队列中获取数据；读取线程对分组压缩块进行解压，并解析对应的BAM数据，直到将整个分组压缩块的数据解析完成生成解析数据块；合并解析数据块，完成BAM文件的读取，本发明通过多个线程同时处理分组后的数据块的解压和解析工作，提升了整个BAM文件读取的效率，同时将读取的压缩数据块按照预设规则分组，调整了解压队列中数据的大小，降低了线程调度时间占比，提升了并行效率。

主权项：1.一种BAM文件并行读取方法，其特征在于，实施步骤包括：1从待解析BAM文件中顺序读取压缩数据块，将上述压缩数据块按照预设规则进行分组，生成由分组压缩块组成的待解压队列；2多个读取线程以分组压缩块为单位，并行从待解压队列中获取数据；3读取线程对获取的分组压缩块进行解压，并解析对应的BAM数据，直到将整个分组压缩块的数据解析完成生成对应的解析数据块；4合并解析数据块，完成BAM文件的读取。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 人和未来生物科技(长沙)有限公司 一种BAM文件并行读取方法、系统及介质

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