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【发明公布】化脓隐秘杆菌分子分型方法、装置及介质_重庆市畜牧科学院_202310940224.X 

申请/专利权人:重庆市畜牧科学院

申请日:2023-07-28

公开(公告)日:2023-11-10

公开(公告)号:CN117037911A

主分类号:G16B30/10

分类号:G16B30/10;G16B10/00;G16B25/20;G16B50/00;C12Q1/6869;C12Q1/689;C12R1/01

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.11.28#实质审查的生效;2023.11.10#公开

摘要:本发明公开了一种化脓隐秘杆菌分子分型方法、装置及介质,该方法包括:获取化脓隐秘杆菌的包含plo全基因的PCR产物、plo全基因序列和或PLO蛋白质全序列;对所述PCR产物进行序列测定;基于化脓隐秘杆菌plo全基因序列,将测定的序列进行拼接以获得plo全基因序列;或采用核苷酸序列翻译软件翻译所拼接的plo全基因以获得PLO蛋白质全序列。根据获取的plo全基因序列和或PLO蛋白质全序列构建分子进化树。本发明采用构建分子进化树的方式对化脓隐秘杆菌进行分子分型,所展示的分型能反映菌株‑宿主种属关联,可用于菌株宿主溯源。

主权项:1.一种化脓隐秘杆菌分子分型方法,其特征在于,所述方法包括:获取化脓隐秘杆菌包含plo全基因的PCR产物、plo全基因序列和或PLO蛋白质全序列;对PCR产物进行序列测定;基于化脓隐秘杆菌plo全基因序列,将测定序列进行拼接;基于拼接的plo全基因翻译获得其所编码的PLO蛋白质序列;根据获得的plo全基因和或PLO蛋白质全序列构建分子进化树。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 重庆市畜牧科学院 化脓隐秘杆菌分子分型方法、装置及介质

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