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【发明授权】一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法_河南农业大学_202111386710.9 

申请/专利权人:河南农业大学

申请日:2021-11-22

公开(公告)日:2023-11-10

公开(公告)号:CN114107443B

主分类号:C12Q1/6809

分类号:C12Q1/6809

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.11.10#授权;2022.03.18#实质审查的生效;2022.03.01#公开

摘要:本发明公开了一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法,属于分子生物学领域;包括下述步骤:1提取泡桐总RNA;2m6A测序:利用泡桐总RNA构建m6A文库,进行测序;3转录组测序:利用泡桐总RNA构建转录组文库,进行测序;4生物信息学分析:对m6A测序结果进行Peak分析,绘制出白花泡桐m6A修饰图谱,并基于Peak分析结果进行m6Amotif预测;对转录组测序结果进行转录组分析;进行m6A与转录组的关联分析,筛选出泡桐丛枝病相关基因。通过本发明方法进行泡桐丛枝病相关基因的分析筛选,为进一步探究泡桐丛枝病的发病机理提供研究思路并打下基础,有助于泡桐丛枝病的防治研究。

主权项:1.一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法,其特征在于,包括下述步骤:(1)提取泡桐总RNA分别提取泡桐丛枝病样本与健康样本,提取泡桐总RNA,进行RNA样品检测;(2)m6A测序利用泡桐总RNA构建m6A文库,进行测序;(3)转录组测序利用泡桐总RNA构建转录组文库,进行测序;(4)生物信息学分析对m6A测序结果进行Peak分析,绘制出白花泡桐m6A修饰图谱,并基于Peak分析结果进行m6Amotif预测;对转录组测序结果进行转录组分析;进行m6A与转录组的关联分析,筛选出泡桐丛枝病相关基因;富集最显著的Motif序列为UUGUUUUGUACU,SEQIDNO.1。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 河南农业大学 一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法

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