申请/专利权人：广州精微医学科技有限公司

申请日：2023-10-09

公开（公告）日：2024-03-19

公开（公告）号：CN117025809B

主分类号：C12Q1/689

分类号：C12Q1/689;C12Q1/6869;C12N15/11;G16B30/10;G16B50/10;C12R1/32

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.19#授权;2024.02.09#著录事项变更;2023.11.28#实质审查的生效;2023.11.10#公开

摘要：本发明公开了结核分歧杆菌复合群鉴定引物组合、试剂盒、方法和系统，属于微生物靶向测序技术领域。引物组合包括靶向扩增结核分枝杆菌、牛结核分枝杆菌、非洲分枝杆菌、田鼠分枝杆菌的特异序列的引物对，还包括靶向扩增rpoB、katG、inhA、gyrA耐药位点的特异序列，人源特异序列以及内参序列的引物对。利用本发明的引物组合及方法，能靶向扩增富集样本中的结核分枝杆菌复合群的特异序列，放大阳性与阴性样本的结果差异，增加判读的可信度，对结核分枝杆菌复合群的特异性检测更为有效，其检出病原微生物的敏感度和特异性更高。

主权项：1.一种结核分枝杆菌复合群鉴定及耐药位点检测引物组合，所述结核分枝杆菌复合群包括结核分枝杆菌，牛结核分枝杆菌，非洲分枝杆菌，田鼠分枝杆菌，其特征在于，所述引物组合包括以下10对引物对：靶向扩增结核分枝杆菌3个特异序列的引物对：SEQIDNo.1和SEQIDNo.2组成的第1引物对，SEQIDNo.3和SEQIDNo.4组成的第2引物对，SEQIDNo.5和SEQIDNo.6组成的第3引物对，特异序列如SEQIDNo.41至SEQIDNo.43所示；靶向扩增牛结核分枝杆菌3个特异序列的引物对：SEQIDNo.7和SEQIDNo.8组成的第4引物对，SEQIDNo.9和SEQIDNo.10组成的第5引物对，SEQIDNo.11和SEQIDNo.12组成的第6引物对，特异序列如SEQIDNo.44至SEQIDNo.46所示；靶向扩增非洲分枝杆菌2个特异序列的引物对：SEQIDNo.13和SEQIDNo.14组成的第7引物对，SEQIDNo.15和SEQIDNo.16组成的第8引物对，特异序列如SEQIDNo.47至SEQIDNo.48所示；靶向扩增田鼠分枝杆菌2个特异序列的引物对：SEQIDNo.17和SEQIDNo.18组成的第9引物对，SEQIDNo.19和SEQIDNo.20组成的第10引物对，特异序列如SEQIDNo.49至SEQIDNo.50所示；所述引物组合还包括靶向扩增rpoB、katG、inhA、gyrA四个耐药基因位点特异序列的引物对：SEQIDNo.21和SEQIDNo.22组成的第11引物对，SEQIDNo.23和SEQIDNo.24组成的第12引物对，SEQIDNo.25和SEQIDNo.26组成的第13引物对，SEQIDNo.27和SEQIDNo.28组成的第14引物对，特异序列如SEQIDNo.51至SEQIDNo.54所示；所述引物组合还包括靶向扩增人源序列的引物对：SEQIDNo.29和SEQIDNo.30组成的第15引物对、SEQIDNo.31和SEQIDNo.32组成的第16引物对，SEQIDNo.33和SEQIDNo.34组成的第17引物对，SEQIDNo.35和SEQIDNo.36组成的第18引物对，SEQIDNo.37和SEQIDNo.38组成的第19引物对，人源序列如SEQIDNo.55至SEQIDNo.59所示；所述引物组合还包括靶向扩增内参序列的引物对：SEQIDNo.39和SEQIDNo.40组成的第20引物对，内参序列如SEQIDNo.60所示。

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