申请/专利权人:上海唯可生物科技有限公司
申请日:2023-12-15
公开(公告)日:2024-03-22
公开(公告)号:CN117746982A
主分类号:G16B20/50
分类号:G16B20/50;G16B25/20;G16B40/30
优先权:
专利状态码:在审-公开
法律状态:2024.03.22#公开
摘要:本发明公开了基于外源DNA插入突变导致的优势克隆的检测方法,对病毒IS信息数据进行正负链矫正、冗余整合的预处理;步骤2、在预处理完成后,对非特异性扩增造成的IS进行识别,以去除因PCR非特异扩增引起的假阳性IS检测结果;步骤3、根据位点聚类算法对临近位置的IS进行合并,并聚类;步骤4、根据聚类结果对克隆平面进行分析,并对优势克隆进行描述;本发明利用PCR引物相似性排名算法,对可能的PCR引物相似性导致的非特异性扩增进行识别和去除,在实际应用中显著降低IS识别的假阳性,提升准确率。
主权项:1.基于外源DNA插入突变导致的优势克隆的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1、对病毒IS信息数据进行正负链矫正、冗余整合的预处理;步骤2、在预处理完成后,对非特异性扩增造成的IS进行识别,以去除因PCR非特异扩增引起的假阳性IS检测结果;步骤3、根据位点聚类算法对临近位置的IS进行合并,并聚类;步骤4、根据聚类结果对克隆平面进行分析,并对优势克隆进行描述。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海唯可生物科技有限公司 基于外源DNA插入突变导致的优势克隆的检测方法
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