申请/专利权人：广州深晓基因科技有限公司

申请日：2020-12-22

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN112522382B

主分类号：C12Q1/6869

分类号：C12Q1/6869;C12N15/10

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.22#授权;2021.04.06#实质审查的生效;2021.03.19#公开

摘要：一种基于液相探针捕获的Y染色体测序方法，包括如下步骤：S1.提取基因组DNA并片段化；S2.对片段化的DNA进行末端修复；S3.在DNA片段两端加上测序接头并纯化连接产物；S4.PCR扩增连有接头的片段DNA进行文库扩增并纯化；S5.文库质量控制；S6.探针区域的挑选及优化，并设计局部密集式探针；S7.将DNA文库和探针进行文库杂交反应，捕获目标DNA片段；S8.将捕获的目标DNA片段进行分离；S9.对分离后的目标DNA片段进行高通量测序。本发明利用液相探针捕获技术，通过对探针区域进行挑选与优化，对Y染色体的测序长度更长，就能够测试到更多的突变，实现了人类Y染色体20M区域的捕获测序。

主权项：1.一种基于液相探针捕获的Y染色体测序方法，其特征在于，包括如下步骤：S1.提取基因组DNA，将基因组DNA进行片段化；S2.对片段化的双链DNA进行末端修复，DNA片段的3’末端加碱基A；S3.在DNA片段两端加上测序接头并纯化连接产物以除去未连接的接头序列；S4.PCR扩增连有接头的片段DNA进行文库扩增并纯化；S5.文库质量控制；S6.探针区域的挑选及优化，并设计局部密集式探针；S7.将步骤S5的DNA文库和步骤S6的探针进行文库杂交反应，捕获目标DNA片段；S8.将捕获的目标DNA片段进行分离；S9.对分离后的目标DNA片段进行高通量测序；其中，步骤S6所述探针区域的挑选及优化为获得hg38版本的Y染色体参考序列，以70bp为截取长度，35bp为滑动窗口，获得重叠覆盖整个NRY区域的70bp单位片段，然后分别用BWA-backtrack、BWA-SW、BWA-MEM和bowtie2四种方法，将所有片段mapping回hg38的参考基因组，接着根据所有片段mapping到Y染色体的唯一性、质量和使用不同mapping方法的一致性，对片段进行评分分级，最后剔除评分最差的片段，把剩余片段进行拼接，得到用于捕获测序的候选区域；所述局部密集式探针为交错式设计；所述探针包括SEQIDNO:1～SEQIDNO:68。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 广州深晓基因科技有限公司 一种基于液相探针捕获的Y染色体测序方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD