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【发明授权】miRNA标志物组合在制备预测年龄产品中的应用_山东第一医科大学(山东省医学科学院)_202410003758.4 

申请/专利权人:山东第一医科大学(山东省医学科学院)

申请日:2024-01-03

公开(公告)日:2024-03-22

公开(公告)号:CN117487937B

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;G16B40/30;C12Q1/6851

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.03.22#授权;2024.02.23#实质审查的生效;2024.02.02#公开

摘要:本发明提供了miRNA标志物组合在制备预测年龄产品中的应用,属于基因工程诊断技术领域。本发明对牙齿样本开发了miRNA提取和荧光定量PCR方法,经上述方法分别得出miR‑22‑3p和miR‑29a‑3p的相对表达量,以kNN模型分析出miR‑22‑3p和miR‑29a‑3p的相对表达量与预测年龄的对应关系,得出样本的预测年龄。本发明应用方法具有高检测灵敏度的特点,仅需要0.05ng的牙齿miRNA即可实现年龄预测,能够对20~70岁人群的牙齿样本进行年龄预测,误差在4.5岁以内。

主权项:1.一种利用miRNA标志物组合预测年龄的方法,其特征在于,所述miRNA标志物组合为牙齿中的miR-22-3p和miR-29a-3p;所述利用miRNA标志物组合预测年龄的方法包括如下步骤:(1)将牙齿粉碎,取牙髓,提取牙髓中的miRNA,反转录得cDNA;(2)对获得的cDNA进行PCR扩增,计算得Ct值,以U6作为内参,以公式△Ct样本=CtmiR-22-3p或miR-29a-3p-CtU6计算得出△Ct样本;(3)以20~30年龄段样品作为对照组,按照步骤(1)和(2)方法计算出△Ct对照;(4)根据基因相对表达量=2-(△Ct样本-△Ct对照)计算出miR-22-3p或miR-29a-3p的相对表达量;(5)基于miR-22-3p和miR-29a-3p的相对表达量用kNN模型进行数据分析,得出预测年龄;所述步骤(1)中对牙髓的处理步骤包括:于牙髓中加入0.5~1.5mL裂解液和8~12μL蛋白酶k,加热震荡1.5~3.5h;所述步骤(1)中进行反转录时,miRNA浓度定为480~520µgL;所述步骤(5)中的具体步骤包括:将步骤(4)计算出的miR-22-3p和miR-29a-3p相对表达量,输入至kNN模型数据库中,设定利用kNN进行数据拟合参数为邻居数:5,度量:欧几里得度量,权重:统一,即可得出预测年龄;所述kNN模型基于Orange软件和训练集中miR-22-3p和miR-29a-3p基因相对表达量和实际年龄构建得到。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 山东第一医科大学(山东省医学科学院) miRNA标志物组合在制备预测年龄产品中的应用

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