申请/专利权人：中日友好医院(中日友好临床医学研究所)

申请日：2024-02-26

公开（公告）日：2024-03-29

公开（公告）号：CN117788465A

主分类号：G06T7/00

分类号：G06T7/00;G06T5/70;G16B30/10

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.16#实质审查的生效;2024.03.29#公开

摘要：一种局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法及装置，建立耳鸣相关的局部脑血流变化与解剖学模式基因表达之间的关系，获得与耳鸣相关的基因，获得与耳鸣相关的基因与蛋白磷酸化通路相关联，将异常局部脑血流相关的基因与细胞类型联系起来，确定GABA在与耳鸣相关的转录变化的关系中起到最重要的贡献。方法包括：提取耳鸣患者和正常对照不同ROI的血流值，将年龄、性别和年龄×性别作为协变量，通过拟合线性模型以估计耳鸣患者和正常被试的差异，得到统计量t值和p值；对区域微阵列表达数据处理；使用偏最小二乘回归分析；进行富集分析和蛋白质网络分析；进行脑细胞类型富集分析。

主权项：1.局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法，其特征在于：其包括以下步骤：（1）使用磁共振扫描仪，配备8通道标准头线圈，进行受试者的磁共振图像采集；（2）检查图像质量，去除变形严重的图像，对图像进行归一化处理，对归一化图像进行平滑处理；（3）提取耳鸣患者和正常对照不同ROI的血流值，将年龄、性别和年龄×性别作为协变量，通过拟合线性模型以估计耳鸣患者和正常被试的差异，得到统计量t值和p值；（4）从AHBA提供的6个死后大脑中获得区域微阵列表达数据，使用abagen工具箱来处理转录组学数据并将其映射到Desikan-Killiany图谱中的83个被分割的大脑区域，通过查找半径为2mm的最近区域，使用校正后的MNI坐标将组织样本分配到大脑区域，样本与区域匹配受到半球和皮质或皮质下分裂的限制，分配给同一大脑区域的样本分别对每个供体进行平均，然后使用sigmoid函数对每个区域中的每个供体的基因表达值进行单独归一化，并重新缩放到单位间隔，最终对供体进行量表平均表达谱，从而形成单个矩阵，每一列对应于大脑区域，每一行对应保留的基因，形成41×15633的基因表达矩阵；（5）使用偏最小二乘回归分析，以检测耳鸣患者和正常对照基因表达值之间的空间关联；（6）使用PLS1+和PLS1-中的所有基因进行富集分析和蛋白质网络分析；（7）使用PLS1+和PLS1-中的所有基因进行脑细胞类型富集分析。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) 局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法及装置

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