申请/专利权人：桂林理工大学

申请日：2021-11-10

公开（公告）日：2024-04-16

公开（公告）号：CN114049913B

主分类号：G16B20/20

分类号：G16B20/20;C12Q1/6895

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.16#授权;2022.03.04#实质审查的生效;2022.02.15#公开

摘要：本发明公开了植物转录因子互作影响的评估方法，构建各试验组各组织中显著表达基因的网络互作图，并筛选出其中存在高度关联的显著表达的关键基因，得到各试验组各组织中显著表达的关键基因的发生概率以及互作概率；全部试验组各组织中显著表达的关键基因的互作概率构成基因互作概率模型；筛选出模型中各试验组各组织的关键转录因子，评估重金属胁迫下化学调控剂对植物转录因子的互作影响水平。本发明植物转录因子互作影响的评估方法为污染物胁迫下外源化学调控剂对水稻幼苗生长的调控策略提供数学模型，直观、高效展现调控水平，为科研人员对污染物胁迫下外源化学调控剂对水稻幼苗生长的调控策略提供了科学有效的评估方法。

主权项：1.植物转录因子互作影响的评估方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：选取化学调控剂，运用植物毒理学手段，对植物幼苗进行重金属短期胁迫；将植物幼苗分为试验组、对照组、空白组；步骤2：计算各试验组根组织和叶片组织中参与胁迫反应的各类转录因子的基因表达变异系数；根据基因表达变异系数的阈值，筛选各试验组根组织和叶片组织中参与胁迫反应的各类转录因子中显著表达的基因；步骤3：构建各试验组根组织和叶片组织中显著表达基因的网络互作图，并筛选出各试验组根组织和叶片组织的网络互作图中存在高度关联的显著促进表达的关键基因以及显著抑制表达的关键基因；步骤4：根据各试验组根组织和叶片组织中筛选出的显著促进表达的关键基因个数以及显著抑制表达的关键基因的个数分别与试验组中参与胁迫反应的各类转录因子基因总数的比值，得到各试验组根组织和叶片组织中显著促进表达的关键基因的发生概率以及显著抑制表达的关键基因的发生概率；步骤5：根据每个试验组根组织和叶片组织中任两种或两种以上显著表达的关键基因的发生概率的乘积，计算得到每个试验组根组织和叶片组织中显著表达的关键基因的互作概率；全部试验组根组织和叶片组织中显著表达的关键基因的互作概率构成化学调控下重金属短期胁迫植物幼苗的基因互作概率模型；步骤6：基于化学调控下重金属短期胁迫植物幼苗的基因互作概率模型，根据关键基因的互作概率的高低，筛选出各试验组根组织和叶片组织的关键转录因子；根据各试验组根组织和叶片组织的关键转录因子，评估重金属胁迫下化学调控剂对植物转录因子的互作影响水平；所述步骤1中，化学调控下经不同浓度重金属短期胁迫的植物幼苗为试验组，未经化学调控的重金属短期胁迫植物幼苗为对照组，未经重金属短期胁迫的植物幼苗为空白组；所述步骤1中，所述化学调控剂为脯氨酸；所述重金属为铬。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 桂林理工大学 植物转录因子互作影响的评估方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD