申请/专利权人：中国农业大学

申请日：2023-12-28

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN117497065B

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B25/20;G16B30/00;G16B50/10;G16B50/30

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.02#授权;2024.02.23#实质审查的生效;2024.02.02#公开

摘要：本发明公开了筛选促进多年生牧草再生的微生物种类的方法及其所用装置与计算机可读存储介质，涉及生物信息学技术领域。本发明要解决的技术问题是如何获得促进多年生牧草再生的微生物种类。本发明提供了筛选促进多年生牧草再生的微生物种类的方法，包括获得不同再生天数的多年生牧草根际土壤微生物的物种信息和物种的丰度分布并进行多样性分析，根据不同再生天数下多年生牧草根际土壤微生物的物种信息、物种的丰度分布以及多样性分析的结果获得促进多年生牧草再生的微生物种类。本发明可用于筛选或辅助筛选促进多年生牧草再生的微生物种类，为利用微生物促进牧草再生、提高牧草产量、改善牧草品质提供数据和技术支持。

主权项：1.筛选或辅助筛选促进多年生牧草再生的微生物种类的方法，其特征在于：所述方法包括获得不同再生天数的多年生牧草根际土壤微生物的物种信息和物种的丰度分布并进行多样性分析，根据不同再生天数下多年生牧草根际土壤微生物的物种信息、物种的丰度分布以及多样性分析的结果获得促进多年生牧草再生的微生物种类；所述物种信息和物种的丰度分布通过如下步骤获得：S1、收集待检测多年生牧草刈割后不同再生天数的根际土壤，得到样本，所述再生天数为大于等于0的自然数；所述再生天数选自0、1、2、7、14、21、28；S2、提取所述样本中的DNA，使用16SrRNA基因特异性引物515F和引物806R进行PCR扩增16SrRNA基因的V4区域，获得16SrRNA基因V4区域文库；所述引物515F的核苷酸序列是SEQIDNo.1，所述引物806R的核苷酸序列是SEQIDNo.2；S3、对所述16SrRNA基因V4区域文库用IlluminaMiseq平台进行测序得到原始数据，并对所述原始数据进行质量控制，得到有效数据；S4、将所述有效数据与Greengenes2数据库比对做物种注释，得到每个样本的根际土壤微生物的物种信息和基于物种的丰度分布；所述物种注释采用QIIME2的q2-greengenes2插件和greengenes2taxonomy命令对所述有效数据中的每个16SrRNA的V4区域进行物种注释。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国农业大学 筛选促进多年生牧草再生的微生物种类的方法及其所用装置与计算机可读存储介质

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