申请/专利权人：深圳铭毅智造科技有限公司

申请日：2023-12-29

公开（公告）日：2024-04-09

公开（公告）号：CN117843704A

主分类号：C07H19/073

分类号：C07H19/073;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C07H19/23

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.04.09#公开

摘要：本发明涉及一种核苷酸衍生物及其在基因测序中的应用，核苷酸衍生物是具有如下式I结构的化合物，或其盐或质子化形式，同时还公开了其作为基因测序试剂以及采用基因测序试剂进行基因测序的方法。该发明的核苷酸衍生物在掺入到生长的链中和裂解反应后，残留在碱基上的是尺寸更小的2或4个原子疤痕，与Illumina试剂在荧光团裂解后留在核苷酸碱基上的10原子疤痕相比，该2或4原子疤痕对测序过程中DNA双链稳定性以及聚合酶识别方面的影响可能更小，有利于测序数据质量以及测序读长测的提升。

主权项：1.一种核苷酸衍生物，其特征在于：所述核苷酸衍生物是具有如下式I结构的化合物，或其盐或质子化形式， 其中X为O或S；n为1-12；BASE为不同的碱基或类似物,所述碱基或类似物是指腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C、胸腺嘧啶T和尿嘧啶U及其类似物；R1-R2独立地为氢、卤素、-CH3、-CCl3、-CBr3、-CF3、-CI3、-CHC12、-CHBr2、-CHF2、-CHI2、-CH2C1、-CH2Br、-CH2F、-CH2I、-CN、-OH、-NH2、-COOH、-CONH2、-NO2、-OCCl3、-OCF3、-OCBr3、-OCI3、-OCHCl2、-OCHBr2、-OCHI2、-OCHF2、-OCH2C1、-OCH2Br、-OCH2I、-OCH2F、-N3、-SF5、取代或未取代的烷基、取代或未取代的杂烷基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的杂环烷基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基中的任意一种；或者聚合酶相容性可裂解部分、荧光基团、能够进行连接反应的可反应活性基团；R3独立地为氢或-O-R3’,其中R3’独立地为氢、卤素、-CH3、-CCl3、-CBr3、-CF3、-CI3、-CHC12、-CHBr2、-CHF2、-CHI2、-CH2C1、-CH2Br、-CH2F、-CH2I、-CN、-OH、-NH2、-COOH、-CONH2、-NO2、-OCCl3、-OCF3、-OCBr3、-OCI3、-OCHCl2、-OCHBr2、-OCHI2、-OCHF2、-OCH2C1、-OCH2Br、-OCH2I、-OCH2F、-N3、-SF5、取代或未取代的烷基；或者聚合酶相容性可裂解部分；R4独立地为H、荧光基团、能够进行连接反应的可反应活性基团或不存在；L1独立地为C1-C4饱和或非饱和脂肪链；L2和L3独立地为C1-C10的饱和或非饱和脂肪链，或聚乙二醇链，或不存在；其中，具有式I结构的化合物在含有金属离子催化剂的还原剂的作用下，3’端丙炔基保护基团和碱基上丙炔醇基链基团同时断裂，重新生成裸露的3’-OH的同时脱去荧光基团或其他标记物。

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