申请/专利权人：渤海水产股份有限公司;天津科技大学

申请日：2024-01-02

公开（公告）日：2024-04-05

公开（公告）号：CN117821611A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开

摘要：本发明提供了一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合及其应用，涉及分子生物学、种质资源学和分子育种技术领域。本发明从290份卤虫资源简化测序产生的53万个SNP标记中筛选设计出13个卤虫核心标记。利用该套标记组合可以应用于构建卤虫SNP指纹图谱，检测卤虫品种的真实性，保证卤虫资源收集的可靠性，可以进行卤虫资源亲缘关系分析，并指导卤虫育种工作。所选择的13个核心SNP标记具有很高的遗传多样性，且稳定性好具有较好的可重复性，有很好的可利用性和推广价值。

主权项：1.一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合，其特征在于，由13个SNP分子标记组成；所述13个SNP分子标记分别为ArtemiaSNP01、ArtemiaSNP02、ArtemiaSNP03、ArtemiaSNP04、ArtemiaSNP05、ArtemiaSNP06、ArtemiaSNP07、ArtemiaSNP08、ArtemiaSNP09、ArtemiaSNP10、ArtemiaSNP11、ArtemiaSNP12和ArtemiaSNP13；所述ArtemiaSNP01位于卤虫的contig14上，物理位置为585775，参考碱基为C，替代碱基为A；所述ArtemiaSNP02位于卤虫的contig30上，物理位置为3557862，参考碱基为T，替代碱基为C；所述ArtemiaSNP03位于卤虫的contig71上，物理位置为1303074，参考碱基为A，替代碱基为T；所述ArtemiaSNP04位于卤虫的contig96上，物理位置为4160684，参考碱基为C，替代碱基为G；所述ArtemiaSNP05位于卤虫的contig210上，物理位置为3460211，参考碱基为G，替代碱基为A；所述ArtemiaSNP06位于卤虫的contig316上，物理位置为451626，参考碱基为T，替代碱基为C；所述ArtemiaSNP07位于卤虫的contig354上，物理位置为393026，参考碱基为A，替代碱基为G；所述ArtemiaSNP08位于卤虫的contig498上，物理位置为463045，参考碱基为C，替代碱基为T；所述ArtemiaSNP09位于卤虫的contig511上，物理位置为1564272，参考碱基为A，替代碱基为G；所述ArtemiaSNP10位于卤虫的contig676上，物理位置为177489，参考碱基为C，替代碱基为T；所述ArtemiaSNP11位于卤虫的contig779上，物理位置为1201204，参考碱基为C，替代碱基为T；所述ArtemiaSNP12位于卤虫的contig2191上，物理位置为107679，参考碱基为A，替代碱基为G；所述ArtemiaSNP13位于卤虫的contig2877上，物理位置为71092，参考碱基为C，替代碱基为T；所述13个SNP分子标记的物理位置是基于卤虫Artemiaparthenogenetica挂载到染色体的contig序列作为参考基因组确定的。

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权利要求：

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