申请/专利权人：淮阴工学院;江苏省农业科学院

申请日：2024-02-02

公开（公告）日：2024-04-12

公开（公告）号：CN117877583A

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30;G16B20/00;G16B40/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.30#实质审查的生效;2024.04.12#公开

摘要：本发明公开了一种基于DAP‑seq和转录组测序数据构建基因调控网络的方法，所述方法通过分析转录因子结合位点和基因表达水平构建一个反映转录因子和其靶基因之间相互作用的综合网络，进而揭示基因调控机制。本发明的方法通过综合考虑转录因子的DNA结合特性和基因表达模式，能够更准确地构建基因调控网络。该方法不仅提高了调控关系预测的准确性，还能够揭示转录因子和基因之间的直接调控关系，为深入理解细胞功能和疾病机制提供了新的工具。

主权项：1.一种基于DAP-seq和转录组测序数据构建基因调控网络的方法，其特征在于，包括如下步骤：1获取特定细胞类型或组织样本的转录组测序数据和DAP-seq数据；2从DAP-seq数据中，识别转录因子的结合位点和相应的结合强度，预测靶基因；3从转录组测序数据中，得到基因共表达网络；4关联转录因子的结合位点与其可能调控的基因，构建初步的转录因子-基因调控对；5结合基因表达水平和转录因子结合强度，通过统计分析方法筛选出显著的转录因子-基因调控对；6构建基因调控网络，该网络由筛选出转录因子-基因调控对形成；7应用网络分析工具，识别在调控网络中具有中心作用的关键转录因子和基因；8进行功能富集分析，探究关键转录因子和基因在生物过程中的作用。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 淮阴工学院;江苏省农业科学院 一种基于DAP-seq和转录组测序数据构建基因调控网络的方法

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