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【发明公布】一种CircRNA-disease-miRNA关联预测方法_齐齐哈尔大学_202310298780.1 

申请/专利权人:齐齐哈尔大学

申请日:2023-03-24

公开(公告)日:2023-07-07

公开(公告)号:CN116403636A

主分类号:G16B5/00

分类号:G16B5/00;G16B40/00;G06F18/25;G06F18/22

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.07.25#实质审查的生效;2023.07.07#公开

摘要:本发明公开了一种CircRNA‑disease‑miRNA关联预测方法,所述方法包括如下步骤:一、构建circRNA‑disease‑miRNA三分网络;二、计算circRNA‑circRNA相似性矩阵;三、计算disease‑disease相似性矩阵;四、计算孤立节点相似度并加入到三分网络中,推断孤立节点与疾病潜在关系;五、为circRNA‑disease‑miRNA分配资源,得到circRNA‑disease权重矩阵、miRNA‑disease权重矩阵;六、对circRNA‑disease权重矩阵和miRNA‑disease权重矩阵进行加权计算,得到circRNA‑disease资源评分矩阵。该方法基于三分网络和融合相似性来预测circRNA‑disease‑miRNA关联信息,通过多方面数据关系、融合相似性和资源分配揭示了隐藏在数据之下的未知关联关系。

主权项:1.一种CircRNA-disease-miRNA关联预测方法,其特征在于所述方法包括如下步骤:步骤一、通过已知的circRNA-disease关联数据集、miRNA-disease关联数据集构建circRNA-disease邻接矩阵ACD、miRNA-disease邻接矩阵AMID;通过ACD和AMID构建circRNA-disease-miRNA构成的三分网络;步骤二、通过融合相似性计算得到circRNA-circRNA相似性矩阵SC;步骤三、通过融合相似性计算得到disease-disease相似性矩阵SD;步骤四、利用circRNA-circRNA相似性或disease-disease相似性与交互轮廓向量计算孤立节点相似度并加入到circRNA-disease-miRNA三分网络中,推断孤立节点与疾病潜在关系;步骤五、通过概率传播机制分配算法为circRNA-disease-miRNA分配资源,得到circRNA-disease权重矩阵WCD、miRNA-disease权重矩阵WMID;步骤六、对circRNA-disease权重矩阵WCD和miRNA-disease权重矩阵WMID进行加权计算,得到circRNA-disease资源评分矩阵Rscore。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 齐齐哈尔大学 一种CircRNA-disease-miRNA关联预测方法

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