申请/专利权人：苏州大学附属第一医院

申请日：2020-05-19

公开（公告）日：2024-01-05

公开（公告）号：CN111613269B

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30;G16B50/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.01.05#授权;2020.09.25#实质审查的生效;2020.09.01#公开

摘要：本发明公开了一种预测HLA相合机率及错配类型的方法，包括以下步骤：（1）构建HLA数据库；（2）录入并提交待比对基因型；（3）将步骤（2）录入的等位基因的格式转换成与HLA数据库中的格式相匹配；（4）将步骤（3）经格式转换后的基因型进行排列组合，得出单倍型组合；（5）将步骤（4）得出的单倍型组合与步骤（1）构建的HLA数据库进行比对；（6）通过比对得到预测结果。本发明所述方法有助于临床选择1010相合机率更大的初筛供者进行确认分型，并在8‑910错配供者中选择可允许错配最优无关供者，节省患者检测费用，对减少移植并发症及提高移植生存均有着重要影响。

主权项：1.一种预测HLA相合机率及错配类型的方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）构建HLA数据库；（2）录入并提交待比对基因型，录入的基因型为HLA-A,B,C,DRB1,DQB1位点基因型；（3）将步骤（2）录入的等位基因的格式转换成与HLA数据库中的格式相匹配；（4）将步骤（3）经格式转换后的基因型进行排列组合，得出单倍型组合；（5）将步骤（4）得出的单倍型组合与步骤（1）构建的HLA数据库进行比对；（6）通过比对得到预测结果；所述HLA数据库包括HLA等位基因CWD数据库、HLA单倍型频率数据库和HLA负连锁数据库；其中所述HLA单倍型频率数据库包括1010相合预测数据库、910相合预测数据库和C,DQB1预测数据库；所述HLA等位基因CWD数据库包含基因型、CWDR、频数；所述1010相合预测数据库包含A-B-C-DRB1-DQB1单倍型、A,B,C,DRB1,DQB1基因型、频数、频率、排序、CWDR；所述910相合预测数据库包括A错配数据库、B错配数据库、C错配数据库、DRB1错配数据库、DQB1错配数据库；每个错配数据库包含错配的单倍型、单倍型对应的错配基因型、频数；所述C,DQB1预测数据库包含A-B-DRB1单倍型、单倍型对应的C,DQB1基因型、频数。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 苏州大学附属第一医院 一种预测HLA相合机率及错配类型的方法

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